Protein–RNA interactions for Protein: P42285

SKIV2L2, Superkiller viralicidic activity 2-like 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2L2P42285 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SKIV2L2P42285 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SKIV2L2P42285 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKIV2L2P42285 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SKIV2L2P42285 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SKIV2L2P42285 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SKIV2L2P42285 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SKIV2L2P42285 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SKIV2L2P42285 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SKIV2L2P42285 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SKIV2L2P42285 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKIV2L2P42285 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKIV2L2P42285 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKIV2L2P42285 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKIV2L2P42285 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKIV2L2P42285 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKIV2L2P42285 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SKIV2L2P42285 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SKIV2L2P42285 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKIV2L2P42285 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SKIV2L2P42285 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKIV2L2P42285 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKIV2L2P42285 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKIV2L2P42285 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKIV2L2P42285 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKIV2L2P42285 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKIV2L2P42285 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SKIV2L2P42285 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SKIV2L2P42285 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SKIV2L2P42285 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SKIV2L2P42285 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SKIV2L2P42285 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SKIV2L2P42285 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKIV2L2P42285 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKIV2L2P42285 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SKIV2L2P42285 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKIV2L2P42285 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SKIV2L2P42285 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKIV2L2P42285 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKIV2L2P42285 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKIV2L2P42285 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKIV2L2P42285 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SKIV2L2P42285 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SKIV2L2P42285 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKIV2L2P42285 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKIV2L2P42285 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SKIV2L2P42285 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKIV2L2P42285 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKIV2L2P42285 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKIV2L2P42285 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKIV2L2P42285 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKIV2L2P42285 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKIV2L2P42285 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKIV2L2P42285 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKIV2L2P42285 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKIV2L2P42285 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKIV2L2P42285 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKIV2L2P42285 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKIV2L2P42285 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SKIV2L2P42285 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SKIV2L2P42285 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SKIV2L2P42285 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SKIV2L2P42285 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SKIV2L2P42285 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SKIV2L2P42285 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SKIV2L2P42285 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKIV2L2P42285 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKIV2L2P42285 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKIV2L2P42285 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKIV2L2P42285 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKIV2L2P42285 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKIV2L2P42285 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SKIV2L2P42285 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKIV2L2P42285 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKIV2L2P42285 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKIV2L2P42285 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKIV2L2P42285 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKIV2L2P42285 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKIV2L2P42285 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKIV2L2P42285 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKIV2L2P42285 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SKIV2L2P42285 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SKIV2L2P42285 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SKIV2L2P42285 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SKIV2L2P42285 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SKIV2L2P42285 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SKIV2L2P42285 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SKIV2L2P42285 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SKIV2L2P42285 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SKIV2L2P42285 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SKIV2L2P42285 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SKIV2L2P42285 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKIV2L2P42285 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKIV2L2P42285 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SKIV2L2P42285 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKIV2L2P42285 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKIV2L2P42285 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SKIV2L2P42285 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SKIV2L2P42285 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SKIV2L2P42285 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms