Protein–RNA interactions for Protein: P40879

SLC26A3, Chloride anion exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A3P40879 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC26A3P40879 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC26A3P40879 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC26A3P40879 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC26A3P40879 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC26A3P40879 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC26A3P40879 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC26A3P40879 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC26A3P40879 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC26A3P40879 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC26A3P40879 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC26A3P40879 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC26A3P40879 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC26A3P40879 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC26A3P40879 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC26A3P40879 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC26A3P40879 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC26A3P40879 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC26A3P40879 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC26A3P40879 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC26A3P40879 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC26A3P40879 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC26A3P40879 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC26A3P40879 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC26A3P40879 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC26A3P40879 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC26A3P40879 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC26A3P40879 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC26A3P40879 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC26A3P40879 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC26A3P40879 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC26A3P40879 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC26A3P40879 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC26A3P40879 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC26A3P40879 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC26A3P40879 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC26A3P40879 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC26A3P40879 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC26A3P40879 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC26A3P40879 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC26A3P40879 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC26A3P40879 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC26A3P40879 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC26A3P40879 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC26A3P40879 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC26A3P40879 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC26A3P40879 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC26A3P40879 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC26A3P40879 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC26A3P40879 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC26A3P40879 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC26A3P40879 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC26A3P40879 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC26A3P40879 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC26A3P40879 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC26A3P40879 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC26A3P40879 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC26A3P40879 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC26A3P40879 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC26A3P40879 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC26A3P40879 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC26A3P40879 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC26A3P40879 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC26A3P40879 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC26A3P40879 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC26A3P40879 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC26A3P40879 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC26A3P40879 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC26A3P40879 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC26A3P40879 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC26A3P40879 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC26A3P40879 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC26A3P40879 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC26A3P40879 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC26A3P40879 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC26A3P40879 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC26A3P40879 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC26A3P40879 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC26A3P40879 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC26A3P40879 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC26A3P40879 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC26A3P40879 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC26A3P40879 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC26A3P40879 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC26A3P40879 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC26A3P40879 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC26A3P40879 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC26A3P40879 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC26A3P40879 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC26A3P40879 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC26A3P40879 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC26A3P40879 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC26A3P40879 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC26A3P40879 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC26A3P40879 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC26A3P40879 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC26A3P40879 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC26A3P40879 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC26A3P40879 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC26A3P40879 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms