Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP8P40818 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP8P40818 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP8P40818 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP8P40818 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP8P40818 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
USP8P40818 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP8P40818 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP8P40818 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP8P40818 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP8P40818 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP8P40818 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP8P40818 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP8P40818 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP8P40818 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP8P40818 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP8P40818 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP8P40818 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP8P40818 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP8P40818 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP8P40818 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP8P40818 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP8P40818 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
USP8P40818 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP8P40818 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP8P40818 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP8P40818 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP8P40818 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP8P40818 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP8P40818 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP8P40818 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP8P40818 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP8P40818 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP8P40818 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP8P40818 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP8P40818 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP8P40818 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP8P40818 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP8P40818 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
USP8P40818 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP8P40818 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP8P40818 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP8P40818 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP8P40818 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP8P40818 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP8P40818 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP8P40818 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP8P40818 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP8P40818 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP8P40818 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP8P40818 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP8P40818 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP8P40818 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP8P40818 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP8P40818 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP8P40818 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP8P40818 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP8P40818 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP8P40818 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP8P40818 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP8P40818 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP8P40818 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP8P40818 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP8P40818 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP8P40818 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP8P40818 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
USP8P40818 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP8P40818 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP8P40818 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP8P40818 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP8P40818 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP8P40818 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP8P40818 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP8P40818 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP8P40818 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP8P40818 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP8P40818 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP8P40818 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP8P40818 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP8P40818 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP8P40818 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP8P40818 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP8P40818 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP8P40818 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP8P40818 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP8P40818 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP8P40818 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
USP8P40818 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP8P40818 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP8P40818 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP8P40818 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP8P40818 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP8P40818 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP8P40818 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP8P40818 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP8P40818 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP8P40818 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP8P40818 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP8P40818 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP8P40818 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms