Protein–RNA interactions for Protein: P39748

FEN1, Flap endonuclease 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FEN1P39748 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FEN1P39748 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FEN1P39748 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FEN1P39748 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FEN1P39748 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FEN1P39748 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FEN1P39748 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FEN1P39748 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FEN1P39748 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FEN1P39748 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FEN1P39748 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FEN1P39748 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FEN1P39748 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FEN1P39748 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FEN1P39748 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FEN1P39748 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FEN1P39748 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FEN1P39748 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FEN1P39748 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FEN1P39748 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FEN1P39748 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FEN1P39748 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FEN1P39748 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FEN1P39748 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FEN1P39748 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FEN1P39748 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FEN1P39748 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FEN1P39748 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FEN1P39748 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FEN1P39748 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FEN1P39748 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FEN1P39748 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FEN1P39748 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FEN1P39748 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FEN1P39748 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FEN1P39748 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FEN1P39748 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FEN1P39748 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FEN1P39748 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FEN1P39748 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FEN1P39748 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FEN1P39748 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FEN1P39748 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FEN1P39748 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FEN1P39748 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FEN1P39748 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FEN1P39748 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FEN1P39748 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FEN1P39748 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FEN1P39748 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
FEN1P39748 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FEN1P39748 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FEN1P39748 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FEN1P39748 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FEN1P39748 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FEN1P39748 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FEN1P39748 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FEN1P39748 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FEN1P39748 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FEN1P39748 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FEN1P39748 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FEN1P39748 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FEN1P39748 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FEN1P39748 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FEN1P39748 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FEN1P39748 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FEN1P39748 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FEN1P39748 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FEN1P39748 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FEN1P39748 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FEN1P39748 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FEN1P39748 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FEN1P39748 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FEN1P39748 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FEN1P39748 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FEN1P39748 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FEN1P39748 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FEN1P39748 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FEN1P39748 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
FEN1P39748 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
FEN1P39748 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FEN1P39748 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FEN1P39748 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FEN1P39748 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FEN1P39748 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FEN1P39748 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FEN1P39748 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FEN1P39748 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FEN1P39748 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FEN1P39748 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FEN1P39748 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FEN1P39748 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FEN1P39748 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FEN1P39748 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FEN1P39748 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FEN1P39748 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FEN1P39748 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FEN1P39748 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FEN1P39748 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FEN1P39748 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms