Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJC1P36383 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJC1P36383 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJC1P36383 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJC1P36383 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJC1P36383 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJC1P36383 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJC1P36383 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJC1P36383 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJC1P36383 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJC1P36383 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJC1P36383 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJC1P36383 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GJC1P36383 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJC1P36383 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJC1P36383 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJC1P36383 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJC1P36383 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJC1P36383 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJC1P36383 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJC1P36383 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJC1P36383 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJC1P36383 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJC1P36383 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJC1P36383 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJC1P36383 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GJC1P36383 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJC1P36383 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJC1P36383 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJC1P36383 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJC1P36383 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJC1P36383 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJC1P36383 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJC1P36383 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJC1P36383 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GJC1P36383 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJC1P36383 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJC1P36383 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJC1P36383 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJC1P36383 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJC1P36383 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJC1P36383 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJC1P36383 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJC1P36383 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJC1P36383 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJC1P36383 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJC1P36383 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJC1P36383 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJC1P36383 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJC1P36383 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJC1P36383 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJC1P36383 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJC1P36383 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJC1P36383 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJC1P36383 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJC1P36383 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJC1P36383 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJC1P36383 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJC1P36383 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJC1P36383 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJC1P36383 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJC1P36383 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJC1P36383 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJC1P36383 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJC1P36383 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJC1P36383 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJC1P36383 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
GJC1P36383 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJC1P36383 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJC1P36383 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJC1P36383 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJC1P36383 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJC1P36383 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJC1P36383 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJC1P36383 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJC1P36383 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJC1P36383 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJC1P36383 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJC1P36383 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GJC1P36383 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJC1P36383 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJC1P36383 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJC1P36383 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJC1P36383 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJC1P36383 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJC1P36383 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJC1P36383 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJC1P36383 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJC1P36383 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJC1P36383 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJC1P36383 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJC1P36383 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJC1P36383 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJC1P36383 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJC1P36383 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJC1P36383 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJC1P36383 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJC1P36383 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJC1P36383 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJC1P36383 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms