Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXD12P35452 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXD12P35452 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXD12P35452 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXD12P35452 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXD12P35452 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXD12P35452 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXD12P35452 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXD12P35452 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXD12P35452 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXD12P35452 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXD12P35452 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXD12P35452 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXD12P35452 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXD12P35452 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXD12P35452 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXD12P35452 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXD12P35452 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXD12P35452 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXD12P35452 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXD12P35452 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXD12P35452 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HOXD12P35452 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXD12P35452 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXD12P35452 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXD12P35452 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXD12P35452 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXD12P35452 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXD12P35452 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXD12P35452 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXD12P35452 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXD12P35452 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXD12P35452 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXD12P35452 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXD12P35452 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXD12P35452 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXD12P35452 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXD12P35452 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXD12P35452 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXD12P35452 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXD12P35452 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXD12P35452 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXD12P35452 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXD12P35452 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXD12P35452 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXD12P35452 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXD12P35452 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXD12P35452 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXD12P35452 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXD12P35452 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXD12P35452 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXD12P35452 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXD12P35452 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXD12P35452 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXD12P35452 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXD12P35452 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXD12P35452 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXD12P35452 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXD12P35452 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXD12P35452 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXD12P35452 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXD12P35452 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXD12P35452 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXD12P35452 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXD12P35452 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXD12P35452 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXD12P35452 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXD12P35452 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXD12P35452 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD12P35452 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD12P35452 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD12P35452 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD12P35452 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXD12P35452 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXD12P35452 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXD12P35452 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXD12P35452 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXD12P35452 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXD12P35452 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXD12P35452 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXD12P35452 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXD12P35452 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXD12P35452 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXD12P35452 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXD12P35452 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXD12P35452 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXD12P35452 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXD12P35452 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXD12P35452 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXD12P35452 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXD12P35452 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXD12P35452 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXD12P35452 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HOXD12P35452 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXD12P35452 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXD12P35452 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXD12P35452 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXD12P35452 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXD12P35452 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXD12P35452 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms