Protein–RNA interactions for Protein: P33947

KDELR2, ER lumen protein-retaining receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR2P33947 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDELR2P33947 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDELR2P33947 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDELR2P33947 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDELR2P33947 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KDELR2P33947 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDELR2P33947 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDELR2P33947 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDELR2P33947 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDELR2P33947 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDELR2P33947 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDELR2P33947 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDELR2P33947 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDELR2P33947 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDELR2P33947 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDELR2P33947 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDELR2P33947 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDELR2P33947 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDELR2P33947 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDELR2P33947 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDELR2P33947 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDELR2P33947 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDELR2P33947 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDELR2P33947 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDELR2P33947 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDELR2P33947 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDELR2P33947 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KDELR2P33947 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KDELR2P33947 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDELR2P33947 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDELR2P33947 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDELR2P33947 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDELR2P33947 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDELR2P33947 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDELR2P33947 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDELR2P33947 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDELR2P33947 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KDELR2P33947 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDELR2P33947 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDELR2P33947 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDELR2P33947 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDELR2P33947 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDELR2P33947 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDELR2P33947 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDELR2P33947 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KDELR2P33947 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDELR2P33947 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDELR2P33947 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KDELR2P33947 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDELR2P33947 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDELR2P33947 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDELR2P33947 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KDELR2P33947 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDELR2P33947 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDELR2P33947 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KDELR2P33947 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDELR2P33947 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDELR2P33947 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KDELR2P33947 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDELR2P33947 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDELR2P33947 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDELR2P33947 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDELR2P33947 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDELR2P33947 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KDELR2P33947 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KDELR2P33947 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KDELR2P33947 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KDELR2P33947 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KDELR2P33947 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KDELR2P33947 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KDELR2P33947 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KDELR2P33947 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KDELR2P33947 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDELR2P33947 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KDELR2P33947 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KDELR2P33947 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KDELR2P33947 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDELR2P33947 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KDELR2P33947 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDELR2P33947 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDELR2P33947 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KDELR2P33947 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDELR2P33947 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDELR2P33947 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KDELR2P33947 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDELR2P33947 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDELR2P33947 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDELR2P33947 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDELR2P33947 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDELR2P33947 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDELR2P33947 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KDELR2P33947 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDELR2P33947 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KDELR2P33947 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDELR2P33947 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDELR2P33947 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDELR2P33947 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDELR2P33947 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KDELR2P33947 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KDELR2P33947 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms