Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNA3P32297 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNA3P32297 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNA3P32297 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNA3P32297 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNA3P32297 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNA3P32297 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHRNA3P32297 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CHRNA3P32297 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHRNA3P32297 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHRNA3P32297 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHRNA3P32297 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHRNA3P32297 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHRNA3P32297 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHRNA3P32297 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRNA3P32297 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRNA3P32297 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRNA3P32297 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHRNA3P32297 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHRNA3P32297 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHRNA3P32297 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHRNA3P32297 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHRNA3P32297 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHRNA3P32297 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHRNA3P32297 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHRNA3P32297 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHRNA3P32297 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CHRNA3P32297 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHRNA3P32297 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHRNA3P32297 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHRNA3P32297 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHRNA3P32297 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHRNA3P32297 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHRNA3P32297 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHRNA3P32297 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHRNA3P32297 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHRNA3P32297 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHRNA3P32297 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CHRNA3P32297 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHRNA3P32297 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHRNA3P32297 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHRNA3P32297 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHRNA3P32297 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CHRNA3P32297 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHRNA3P32297 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHRNA3P32297 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHRNA3P32297 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHRNA3P32297 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHRNA3P32297 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHRNA3P32297 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHRNA3P32297 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHRNA3P32297 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHRNA3P32297 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHRNA3P32297 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHRNA3P32297 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHRNA3P32297 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHRNA3P32297 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHRNA3P32297 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHRNA3P32297 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHRNA3P32297 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHRNA3P32297 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHRNA3P32297 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHRNA3P32297 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNA3P32297 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNA3P32297 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNA3P32297 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNA3P32297 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHRNA3P32297 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHRNA3P32297 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CHRNA3P32297 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHRNA3P32297 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNA3P32297 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNA3P32297 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNA3P32297 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNA3P32297 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNA3P32297 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNA3P32297 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNA3P32297 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNA3P32297 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNA3P32297 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNA3P32297 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNA3P32297 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNA3P32297 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNA3P32297 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNA3P32297 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNA3P32297 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNA3P32297 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNA3P32297 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNA3P32297 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNA3P32297 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRNA3P32297 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRNA3P32297 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRNA3P32297 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRNA3P32297 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRNA3P32297 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRNA3P32297 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRNA3P32297 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRNA3P32297 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNA3P32297 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRNA3P32297 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms