Protein–RNA interactions for Protein: P32242

OTX1, Homeobox protein OTX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX1P32242 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OTX1P32242 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTX1P32242 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTX1P32242 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTX1P32242 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTX1P32242 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTX1P32242 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTX1P32242 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTX1P32242 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTX1P32242 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
OTX1P32242 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTX1P32242 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTX1P32242 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTX1P32242 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTX1P32242 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTX1P32242 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTX1P32242 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTX1P32242 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTX1P32242 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTX1P32242 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTX1P32242 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTX1P32242 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTX1P32242 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTX1P32242 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTX1P32242 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTX1P32242 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTX1P32242 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTX1P32242 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
OTX1P32242 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTX1P32242 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTX1P32242 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTX1P32242 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
OTX1P32242 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
OTX1P32242 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTX1P32242 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTX1P32242 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTX1P32242 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTX1P32242 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTX1P32242 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTX1P32242 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTX1P32242 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTX1P32242 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
OTX1P32242 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
OTX1P32242 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
OTX1P32242 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTX1P32242 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTX1P32242 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTX1P32242 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTX1P32242 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTX1P32242 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTX1P32242 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTX1P32242 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTX1P32242 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTX1P32242 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTX1P32242 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTX1P32242 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTX1P32242 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTX1P32242 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTX1P32242 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTX1P32242 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTX1P32242 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTX1P32242 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTX1P32242 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTX1P32242 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTX1P32242 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTX1P32242 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTX1P32242 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OTX1P32242 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTX1P32242 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTX1P32242 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTX1P32242 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
OTX1P32242 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
OTX1P32242 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OTX1P32242 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTX1P32242 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTX1P32242 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
OTX1P32242 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTX1P32242 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTX1P32242 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OTX1P32242 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
OTX1P32242 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
OTX1P32242 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
OTX1P32242 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
OTX1P32242 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
OTX1P32242 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
OTX1P32242 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
OTX1P32242 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
OTX1P32242 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
OTX1P32242 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
OTX1P32242 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
OTX1P32242 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
OTX1P32242 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
OTX1P32242 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
OTX1P32242 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
OTX1P32242 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
OTX1P32242 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
OTX1P32242 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
OTX1P32242 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
OTX1P32242 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
OTX1P32242 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms