Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCKARP32238 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCKARP32238 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCKARP32238 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCKARP32238 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCKARP32238 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCKARP32238 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCKARP32238 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCKARP32238 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCKARP32238 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCKARP32238 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCKARP32238 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCKARP32238 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCKARP32238 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCKARP32238 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCKARP32238 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCKARP32238 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCKARP32238 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCKARP32238 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCKARP32238 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCKARP32238 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCKARP32238 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCKARP32238 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCKARP32238 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCKARP32238 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCKARP32238 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCKARP32238 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCKARP32238 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCKARP32238 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCKARP32238 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCKARP32238 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCKARP32238 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCKARP32238 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCKARP32238 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCKARP32238 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCKARP32238 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCKARP32238 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCKARP32238 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCKARP32238 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCKARP32238 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCKARP32238 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCKARP32238 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCKARP32238 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCKARP32238 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCKARP32238 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCKARP32238 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCKARP32238 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCKARP32238 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCKARP32238 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCKARP32238 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCKARP32238 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCKARP32238 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCKARP32238 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCKARP32238 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCKARP32238 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCKARP32238 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCKARP32238 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCKARP32238 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCKARP32238 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCKARP32238 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCKARP32238 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCKARP32238 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCKARP32238 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCKARP32238 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCKARP32238 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCKARP32238 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCKARP32238 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCKARP32238 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCKARP32238 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCKARP32238 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCKARP32238 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCKARP32238 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCKARP32238 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCKARP32238 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCKARP32238 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCKARP32238 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCKARP32238 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCKARP32238 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCKARP32238 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCKARP32238 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCKARP32238 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCKARP32238 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCKARP32238 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCKARP32238 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CCKARP32238 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCKARP32238 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCKARP32238 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCKARP32238 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCKARP32238 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCKARP32238 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCKARP32238 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCKARP32238 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCKARP32238 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCKARP32238 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCKARP32238 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCKARP32238 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCKARP32238 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCKARP32238 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCKARP32238 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCKARP32238 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms