Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ECHS1P30084 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ECHS1P30084 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ECHS1P30084 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ECHS1P30084 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ECHS1P30084 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ECHS1P30084 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ECHS1P30084 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ECHS1P30084 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ECHS1P30084 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ECHS1P30084 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ECHS1P30084 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ECHS1P30084 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ECHS1P30084 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ECHS1P30084 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ECHS1P30084 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ECHS1P30084 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ECHS1P30084 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ECHS1P30084 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ECHS1P30084 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ECHS1P30084 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ECHS1P30084 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ECHS1P30084 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ECHS1P30084 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ECHS1P30084 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ECHS1P30084 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ECHS1P30084 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ECHS1P30084 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ECHS1P30084 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ECHS1P30084 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ECHS1P30084 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ECHS1P30084 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ECHS1P30084 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ECHS1P30084 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ECHS1P30084 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ECHS1P30084 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ECHS1P30084 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ECHS1P30084 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ECHS1P30084 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ECHS1P30084 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ECHS1P30084 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ECHS1P30084 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ECHS1P30084 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ECHS1P30084 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ECHS1P30084 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ECHS1P30084 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ECHS1P30084 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ECHS1P30084 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ECHS1P30084 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ECHS1P30084 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ECHS1P30084 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ECHS1P30084 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ECHS1P30084 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ECHS1P30084 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ECHS1P30084 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ECHS1P30084 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ECHS1P30084 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ECHS1P30084 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ECHS1P30084 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ECHS1P30084 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ECHS1P30084 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ECHS1P30084 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ECHS1P30084 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ECHS1P30084 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ECHS1P30084 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ECHS1P30084 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ECHS1P30084 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ECHS1P30084 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ECHS1P30084 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ECHS1P30084 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ECHS1P30084 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ECHS1P30084 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ECHS1P30084 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ECHS1P30084 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ECHS1P30084 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ECHS1P30084 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ECHS1P30084 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ECHS1P30084 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ECHS1P30084 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ECHS1P30084 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ECHS1P30084 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ECHS1P30084 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ECHS1P30084 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ECHS1P30084 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ECHS1P30084 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ECHS1P30084 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ECHS1P30084 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ECHS1P30084 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ECHS1P30084 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ECHS1P30084 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ECHS1P30084 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ECHS1P30084 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ECHS1P30084 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ECHS1P30084 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ECHS1P30084 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ECHS1P30084 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ECHS1P30084 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ECHS1P30084 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ECHS1P30084 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ECHS1P30084 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms