Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD40LGP29965 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD40LGP29965 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD40LGP29965 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CD40LGP29965 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD40LGP29965 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD40LGP29965 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CD40LGP29965 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD40LGP29965 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD40LGP29965 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD40LGP29965 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD40LGP29965 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD40LGP29965 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD40LGP29965 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD40LGP29965 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD40LGP29965 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD40LGP29965 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD40LGP29965 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CD40LGP29965 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD40LGP29965 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD40LGP29965 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD40LGP29965 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD40LGP29965 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD40LGP29965 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD40LGP29965 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD40LGP29965 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD40LGP29965 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CD40LGP29965 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD40LGP29965 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD40LGP29965 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD40LGP29965 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD40LGP29965 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD40LGP29965 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD40LGP29965 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD40LGP29965 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD40LGP29965 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD40LGP29965 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD40LGP29965 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CD40LGP29965 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD40LGP29965 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD40LGP29965 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD40LGP29965 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD40LGP29965 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD40LGP29965 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD40LGP29965 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD40LGP29965 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD40LGP29965 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD40LGP29965 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD40LGP29965 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD40LGP29965 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD40LGP29965 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD40LGP29965 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD40LGP29965 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD40LGP29965 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD40LGP29965 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CD40LGP29965 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CD40LGP29965 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CD40LGP29965 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD40LGP29965 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD40LGP29965 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD40LGP29965 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD40LGP29965 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD40LGP29965 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD40LGP29965 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD40LGP29965 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD40LGP29965 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD40LGP29965 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD40LGP29965 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD40LGP29965 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD40LGP29965 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD40LGP29965 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD40LGP29965 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD40LGP29965 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD40LGP29965 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD40LGP29965 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD40LGP29965 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD40LGP29965 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD40LGP29965 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CD40LGP29965 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD40LGP29965 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD40LGP29965 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD40LGP29965 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD40LGP29965 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD40LGP29965 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD40LGP29965 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD40LGP29965 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD40LGP29965 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CD40LGP29965 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD40LGP29965 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD40LGP29965 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD40LGP29965 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD40LGP29965 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD40LGP29965 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD40LGP29965 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CD40LGP29965 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD40LGP29965 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD40LGP29965 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD40LGP29965 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD40LGP29965 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CD40LGP29965 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms