Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CRABP1P29762 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CRABP1P29762 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CRABP1P29762 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CRABP1P29762 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRABP1P29762 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRABP1P29762 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRABP1P29762 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRABP1P29762 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRABP1P29762 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRABP1P29762 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRABP1P29762 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CRABP1P29762 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CRABP1P29762 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRABP1P29762 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CRABP1P29762 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRABP1P29762 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRABP1P29762 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRABP1P29762 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRABP1P29762 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CRABP1P29762 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRABP1P29762 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRABP1P29762 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRABP1P29762 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRABP1P29762 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRABP1P29762 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRABP1P29762 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRABP1P29762 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRABP1P29762 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRABP1P29762 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRABP1P29762 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRABP1P29762 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRABP1P29762 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRABP1P29762 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRABP1P29762 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRABP1P29762 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRABP1P29762 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRABP1P29762 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRABP1P29762 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRABP1P29762 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRABP1P29762 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRABP1P29762 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRABP1P29762 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRABP1P29762 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRABP1P29762 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRABP1P29762 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRABP1P29762 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CRABP1P29762 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CRABP1P29762 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRABP1P29762 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRABP1P29762 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRABP1P29762 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRABP1P29762 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRABP1P29762 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRABP1P29762 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRABP1P29762 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRABP1P29762 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRABP1P29762 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRABP1P29762 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CRABP1P29762 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRABP1P29762 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRABP1P29762 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRABP1P29762 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CRABP1P29762 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CRABP1P29762 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRABP1P29762 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRABP1P29762 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRABP1P29762 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CRABP1P29762 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRABP1P29762 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRABP1P29762 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRABP1P29762 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRABP1P29762 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRABP1P29762 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRABP1P29762 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRABP1P29762 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRABP1P29762 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CRABP1P29762 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CRABP1P29762 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRABP1P29762 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRABP1P29762 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CRABP1P29762 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRABP1P29762 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRABP1P29762 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRABP1P29762 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRABP1P29762 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CRABP1P29762 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRABP1P29762 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRABP1P29762 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRABP1P29762 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRABP1P29762 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRABP1P29762 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRABP1P29762 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRABP1P29762 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CRABP1P29762 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRABP1P29762 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRABP1P29762 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRABP1P29762 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRABP1P29762 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRABP1P29762 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms