Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHC1P29353 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SHC1P29353 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHC1P29353 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHC1P29353 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHC1P29353 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHC1P29353 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHC1P29353 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHC1P29353 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SHC1P29353 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHC1P29353 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHC1P29353 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHC1P29353 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHC1P29353 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHC1P29353 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHC1P29353 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHC1P29353 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHC1P29353 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHC1P29353 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHC1P29353 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHC1P29353 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHC1P29353 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHC1P29353 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHC1P29353 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHC1P29353 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHC1P29353 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHC1P29353 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHC1P29353 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHC1P29353 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHC1P29353 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHC1P29353 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHC1P29353 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHC1P29353 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SHC1P29353 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHC1P29353 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHC1P29353 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHC1P29353 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHC1P29353 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHC1P29353 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHC1P29353 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHC1P29353 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHC1P29353 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHC1P29353 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SHC1P29353 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHC1P29353 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHC1P29353 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHC1P29353 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHC1P29353 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SHC1P29353 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHC1P29353 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHC1P29353 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHC1P29353 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHC1P29353 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHC1P29353 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHC1P29353 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHC1P29353 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHC1P29353 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHC1P29353 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SHC1P29353 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHC1P29353 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SHC1P29353 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SHC1P29353 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHC1P29353 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHC1P29353 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHC1P29353 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHC1P29353 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHC1P29353 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SHC1P29353 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHC1P29353 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHC1P29353 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHC1P29353 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHC1P29353 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHC1P29353 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHC1P29353 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHC1P29353 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHC1P29353 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHC1P29353 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHC1P29353 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SHC1P29353 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHC1P29353 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHC1P29353 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SHC1P29353 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHC1P29353 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHC1P29353 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHC1P29353 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHC1P29353 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHC1P29353 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHC1P29353 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHC1P29353 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHC1P29353 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHC1P29353 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHC1P29353 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHC1P29353 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHC1P29353 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHC1P29353 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHC1P29353 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHC1P29353 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHC1P29353 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHC1P29353 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHC1P29353 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms