Protein–RNA interactions for Protein: P28331

NDUFS1, NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS1P28331 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDUFS1P28331 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDUFS1P28331 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NDUFS1P28331 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDUFS1P28331 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDUFS1P28331 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDUFS1P28331 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDUFS1P28331 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDUFS1P28331 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDUFS1P28331 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDUFS1P28331 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NDUFS1P28331 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDUFS1P28331 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDUFS1P28331 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDUFS1P28331 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDUFS1P28331 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDUFS1P28331 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDUFS1P28331 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDUFS1P28331 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NDUFS1P28331 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDUFS1P28331 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDUFS1P28331 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NDUFS1P28331 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDUFS1P28331 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDUFS1P28331 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDUFS1P28331 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDUFS1P28331 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NDUFS1P28331 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NDUFS1P28331 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NDUFS1P28331 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NDUFS1P28331 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NDUFS1P28331 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NDUFS1P28331 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NDUFS1P28331 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NDUFS1P28331 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDUFS1P28331 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDUFS1P28331 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDUFS1P28331 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDUFS1P28331 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDUFS1P28331 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDUFS1P28331 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NDUFS1P28331 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NDUFS1P28331 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDUFS1P28331 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDUFS1P28331 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDUFS1P28331 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDUFS1P28331 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDUFS1P28331 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDUFS1P28331 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDUFS1P28331 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NDUFS1P28331 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDUFS1P28331 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDUFS1P28331 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDUFS1P28331 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDUFS1P28331 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDUFS1P28331 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDUFS1P28331 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDUFS1P28331 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDUFS1P28331 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDUFS1P28331 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDUFS1P28331 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NDUFS1P28331 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDUFS1P28331 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDUFS1P28331 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDUFS1P28331 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDUFS1P28331 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDUFS1P28331 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDUFS1P28331 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NDUFS1P28331 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NDUFS1P28331 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NDUFS1P28331 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NDUFS1P28331 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NDUFS1P28331 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDUFS1P28331 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDUFS1P28331 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDUFS1P28331 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDUFS1P28331 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDUFS1P28331 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDUFS1P28331 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDUFS1P28331 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDUFS1P28331 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDUFS1P28331 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDUFS1P28331 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDUFS1P28331 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDUFS1P28331 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDUFS1P28331 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NDUFS1P28331 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDUFS1P28331 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDUFS1P28331 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDUFS1P28331 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDUFS1P28331 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDUFS1P28331 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDUFS1P28331 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDUFS1P28331 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDUFS1P28331 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDUFS1P28331 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDUFS1P28331 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDUFS1P28331 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NDUFS1P28331 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDUFS1P28331 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms