Protein–RNA interactions for Protein: P28289

TMOD1, Tropomodulin-1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1P28289 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMOD1P28289 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMOD1P28289 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMOD1P28289 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMOD1P28289 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMOD1P28289 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMOD1P28289 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMOD1P28289 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMOD1P28289 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMOD1P28289 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMOD1P28289 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMOD1P28289 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMOD1P28289 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMOD1P28289 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMOD1P28289 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMOD1P28289 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMOD1P28289 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMOD1P28289 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMOD1P28289 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMOD1P28289 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TMOD1P28289 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMOD1P28289 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMOD1P28289 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMOD1P28289 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMOD1P28289 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMOD1P28289 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMOD1P28289 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TMOD1P28289 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMOD1P28289 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMOD1P28289 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TMOD1P28289 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMOD1P28289 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMOD1P28289 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TMOD1P28289 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMOD1P28289 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMOD1P28289 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMOD1P28289 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMOD1P28289 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMOD1P28289 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMOD1P28289 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMOD1P28289 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMOD1P28289 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMOD1P28289 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMOD1P28289 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMOD1P28289 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMOD1P28289 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMOD1P28289 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMOD1P28289 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMOD1P28289 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMOD1P28289 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMOD1P28289 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMOD1P28289 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMOD1P28289 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TMOD1P28289 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMOD1P28289 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMOD1P28289 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
TMOD1P28289 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMOD1P28289 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMOD1P28289 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMOD1P28289 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMOD1P28289 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMOD1P28289 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMOD1P28289 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMOD1P28289 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TMOD1P28289 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMOD1P28289 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMOD1P28289 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMOD1P28289 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMOD1P28289 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMOD1P28289 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMOD1P28289 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TMOD1P28289 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMOD1P28289 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMOD1P28289 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMOD1P28289 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMOD1P28289 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMOD1P28289 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMOD1P28289 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TMOD1P28289 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMOD1P28289 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMOD1P28289 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMOD1P28289 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMOD1P28289 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMOD1P28289 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMOD1P28289 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMOD1P28289 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMOD1P28289 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMOD1P28289 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMOD1P28289 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMOD1P28289 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMOD1P28289 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMOD1P28289 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TMOD1P28289 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMOD1P28289 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMOD1P28289 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMOD1P28289 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TMOD1P28289 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMOD1P28289 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMOD1P28289 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMOD1P28289 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms