Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLNP26678 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLNP26678 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLNP26678 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLNP26678 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PLNP26678 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLNP26678 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLNP26678 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLNP26678 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLNP26678 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLNP26678 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLNP26678 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLNP26678 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PLNP26678 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLNP26678 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLNP26678 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLNP26678 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLNP26678 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLNP26678 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLNP26678 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLNP26678 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLNP26678 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLNP26678 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLNP26678 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLNP26678 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PLNP26678 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PLNP26678 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLNP26678 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLNP26678 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLNP26678 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLNP26678 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLNP26678 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLNP26678 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PLNP26678 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLNP26678 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PLNP26678 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLNP26678 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLNP26678 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLNP26678 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PLNP26678 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PLNP26678 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PLNP26678 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PLNP26678 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PLNP26678 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PLNP26678 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PLNP26678 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PLNP26678 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PLNP26678 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLNP26678 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLNP26678 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLNP26678 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLNP26678 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLNP26678 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PLNP26678 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PLNP26678 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLNP26678 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLNP26678 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLNP26678 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLNP26678 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLNP26678 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLNP26678 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLNP26678 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLNP26678 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLNP26678 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLNP26678 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLNP26678 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLNP26678 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLNP26678 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLNP26678 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLNP26678 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLNP26678 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLNP26678 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLNP26678 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLNP26678 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLNP26678 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLNP26678 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLNP26678 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLNP26678 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLNP26678 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLNP26678 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLNP26678 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLNP26678 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PLNP26678 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLNP26678 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLNP26678 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLNP26678 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLNP26678 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLNP26678 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLNP26678 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLNP26678 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
PLNP26678 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PLNP26678 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PLNP26678 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLNP26678 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLNP26678 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLNP26678 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLNP26678 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLNP26678 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLNP26678 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PLNP26678 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms