Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
DNMT1P26358 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
DNMT1P26358 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
DNMT1P26358 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
DNMT1P26358 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
DNMT1P26358 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.53
DNMT1P26358 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
DNMT1P26358 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
DNMT1P26358 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
DNMT1P26358 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
DNMT1P26358 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
DNMT1P26358 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
DNMT1P26358 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
DNMT1P26358 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
DNMT1P26358 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
DNMT1P26358 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
DNMT1P26358 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
DNMT1P26358 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
DNMT1P26358 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
DNMT1P26358 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
DNMT1P26358 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC37.04■■■■□ 3.52
DNMT1P26358 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
DNMT1P26358 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
DNMT1P26358 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
DNMT1P26358 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
DNMT1P26358 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
DNMT1P26358 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
DNMT1P26358 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
DNMT1P26358 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
DNMT1P26358 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
DNMT1P26358 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
DNMT1P26358 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
DNMT1P26358 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC37■■■■□ 3.51
DNMT1P26358 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
DNMT1P26358 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
DNMT1P26358 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
DNMT1P26358 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
DNMT1P26358 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
DNMT1P26358 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
DNMT1P26358 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
DNMT1P26358 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
DNMT1P26358 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
DNMT1P26358 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
DNMT1P26358 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
DNMT1P26358 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
DNMT1P26358 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
DNMT1P26358 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
DNMT1P26358 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
DNMT1P26358 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
DNMT1P26358 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
DNMT1P26358 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
DNMT1P26358 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
DNMT1P26358 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
DNMT1P26358 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
DNMT1P26358 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
DNMT1P26358 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
DNMT1P26358 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
DNMT1P26358 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
DNMT1P26358 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
DNMT1P26358 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
DNMT1P26358 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
DNMT1P26358 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
DNMT1P26358 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.5
DNMT1P26358 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
DNMT1P26358 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
DNMT1P26358 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
DNMT1P26358 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
DNMT1P26358 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
DNMT1P26358 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
DNMT1P26358 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
DNMT1P26358 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
DNMT1P26358 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
DNMT1P26358 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
DNMT1P26358 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
DNMT1P26358 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
DNMT1P26358 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
DNMT1P26358 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
DNMT1P26358 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
DNMT1P26358 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
DNMT1P26358 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
DNMT1P26358 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
DNMT1P26358 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
DNMT1P26358 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
DNMT1P26358 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
DNMT1P26358 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
DNMT1P26358 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
DNMT1P26358 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
DNMT1P26358 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
DNMT1P26358 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
DNMT1P26358 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC36.87■■■■□ 3.49
DNMT1P26358 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
DNMT1P26358 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
DNMT1P26358 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
DNMT1P26358 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
DNMT1P26358 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
DNMT1P26358 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
DNMT1P26358 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
DNMT1P26358 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
DNMT1P26358 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
DNMT1P26358 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms