Protein–RNA interactions for Protein: P26045

PTPN3, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3P26045 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN3P26045 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN3P26045 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN3P26045 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN3P26045 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN3P26045 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN3P26045 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN3P26045 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN3P26045 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN3P26045 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN3P26045 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN3P26045 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN3P26045 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN3P26045 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN3P26045 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN3P26045 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN3P26045 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN3P26045 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPN3P26045 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPN3P26045 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPN3P26045 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN3P26045 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN3P26045 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN3P26045 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN3P26045 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN3P26045 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN3P26045 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN3P26045 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN3P26045 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN3P26045 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN3P26045 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN3P26045 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN3P26045 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN3P26045 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN3P26045 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN3P26045 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN3P26045 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN3P26045 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN3P26045 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN3P26045 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN3P26045 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN3P26045 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN3P26045 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN3P26045 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN3P26045 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN3P26045 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN3P26045 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN3P26045 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN3P26045 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN3P26045 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN3P26045 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN3P26045 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPN3P26045 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN3P26045 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN3P26045 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN3P26045 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN3P26045 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN3P26045 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN3P26045 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN3P26045 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN3P26045 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN3P26045 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN3P26045 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN3P26045 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN3P26045 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN3P26045 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN3P26045 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN3P26045 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN3P26045 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN3P26045 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN3P26045 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN3P26045 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN3P26045 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN3P26045 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN3P26045 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN3P26045 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN3P26045 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN3P26045 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN3P26045 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN3P26045 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN3P26045 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN3P26045 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN3P26045 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN3P26045 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN3P26045 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN3P26045 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN3P26045 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN3P26045 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN3P26045 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN3P26045 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN3P26045 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN3P26045 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN3P26045 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN3P26045 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN3P26045 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN3P26045 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN3P26045 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN3P26045 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN3P26045 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN3P26045 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms