Protein–RNA interactions for Protein: P23588

EIF4B, Eukaryotic translation initiation factor 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4BP23588 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EIF4BP23588 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EIF4BP23588 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EIF4BP23588 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EIF4BP23588 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EIF4BP23588 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EIF4BP23588 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EIF4BP23588 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EIF4BP23588 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EIF4BP23588 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EIF4BP23588 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EIF4BP23588 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
EIF4BP23588 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EIF4BP23588 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EIF4BP23588 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
EIF4BP23588 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
EIF4BP23588 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EIF4BP23588 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EIF4BP23588 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EIF4BP23588 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EIF4BP23588 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EIF4BP23588 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EIF4BP23588 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EIF4BP23588 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EIF4BP23588 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EIF4BP23588 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EIF4BP23588 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EIF4BP23588 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EIF4BP23588 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EIF4BP23588 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EIF4BP23588 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EIF4BP23588 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EIF4BP23588 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
EIF4BP23588 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EIF4BP23588 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EIF4BP23588 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EIF4BP23588 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
EIF4BP23588 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EIF4BP23588 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EIF4BP23588 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EIF4BP23588 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EIF4BP23588 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EIF4BP23588 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EIF4BP23588 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EIF4BP23588 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EIF4BP23588 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EIF4BP23588 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EIF4BP23588 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EIF4BP23588 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EIF4BP23588 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EIF4BP23588 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EIF4BP23588 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
EIF4BP23588 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EIF4BP23588 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EIF4BP23588 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EIF4BP23588 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EIF4BP23588 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EIF4BP23588 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EIF4BP23588 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EIF4BP23588 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EIF4BP23588 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EIF4BP23588 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EIF4BP23588 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EIF4BP23588 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EIF4BP23588 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EIF4BP23588 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EIF4BP23588 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EIF4BP23588 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EIF4BP23588 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EIF4BP23588 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EIF4BP23588 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EIF4BP23588 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EIF4BP23588 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF4BP23588 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF4BP23588 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF4BP23588 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF4BP23588 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF4BP23588 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF4BP23588 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF4BP23588 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EIF4BP23588 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EIF4BP23588 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EIF4BP23588 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EIF4BP23588 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EIF4BP23588 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
EIF4BP23588 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EIF4BP23588 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
EIF4BP23588 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EIF4BP23588 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EIF4BP23588 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EIF4BP23588 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EIF4BP23588 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EIF4BP23588 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EIF4BP23588 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EIF4BP23588 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EIF4BP23588 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EIF4BP23588 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
EIF4BP23588 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EIF4BP23588 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EIF4BP23588 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms