Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RPS6KB1P23443 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RPS6KB1P23443 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RPS6KB1P23443 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
RPS6KB1P23443 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RPS6KB1P23443 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
RPS6KB1P23443 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RPS6KB1P23443 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
RPS6KB1P23443 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RPS6KB1P23443 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RPS6KB1P23443 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RPS6KB1P23443 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RPS6KB1P23443 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RPS6KB1P23443 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RPS6KB1P23443 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RPS6KB1P23443 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RPS6KB1P23443 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RPS6KB1P23443 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RPS6KB1P23443 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RPS6KB1P23443 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RPS6KB1P23443 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RPS6KB1P23443 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RPS6KB1P23443 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RPS6KB1P23443 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RPS6KB1P23443 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RPS6KB1P23443 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RPS6KB1P23443 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RPS6KB1P23443 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RPS6KB1P23443 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RPS6KB1P23443 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RPS6KB1P23443 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RPS6KB1P23443 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RPS6KB1P23443 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RPS6KB1P23443 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RPS6KB1P23443 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RPS6KB1P23443 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RPS6KB1P23443 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RPS6KB1P23443 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RPS6KB1P23443 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RPS6KB1P23443 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RPS6KB1P23443 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
RPS6KB1P23443 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RPS6KB1P23443 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RPS6KB1P23443 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RPS6KB1P23443 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RPS6KB1P23443 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
RPS6KB1P23443 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RPS6KB1P23443 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RPS6KB1P23443 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RPS6KB1P23443 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RPS6KB1P23443 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RPS6KB1P23443 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RPS6KB1P23443 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RPS6KB1P23443 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RPS6KB1P23443 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RPS6KB1P23443 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RPS6KB1P23443 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RPS6KB1P23443 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
RPS6KB1P23443 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RPS6KB1P23443 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RPS6KB1P23443 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RPS6KB1P23443 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RPS6KB1P23443 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RPS6KB1P23443 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RPS6KB1P23443 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RPS6KB1P23443 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RPS6KB1P23443 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RPS6KB1P23443 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RPS6KB1P23443 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
RPS6KB1P23443 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RPS6KB1P23443 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RPS6KB1P23443 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RPS6KB1P23443 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RPS6KB1P23443 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RPS6KB1P23443 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RPS6KB1P23443 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RPS6KB1P23443 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
RPS6KB1P23443 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RPS6KB1P23443 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RPS6KB1P23443 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RPS6KB1P23443 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RPS6KB1P23443 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RPS6KB1P23443 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RPS6KB1P23443 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RPS6KB1P23443 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RPS6KB1P23443 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RPS6KB1P23443 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RPS6KB1P23443 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RPS6KB1P23443 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RPS6KB1P23443 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RPS6KB1P23443 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RPS6KB1P23443 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RPS6KB1P23443 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RPS6KB1P23443 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RPS6KB1P23443 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RPS6KB1P23443 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
RPS6KB1P23443 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RPS6KB1P23443 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RPS6KB1P23443 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RPS6KB1P23443 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms