Protein–RNA interactions for Protein: P23396

RPS3, 40S ribosomal protein S3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3P23396 WDR74-217ENST00000545112 788 ntTSL 218.76■□□□□ 0.594e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.594e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 CORO7-211ENST00000572044 563 ntTSL 418.64■□□□□ 0.574e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.574e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.564e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 HSPG2-210ENST00000481644 839 ntTSL 218.19■□□□□ 0.54e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.494e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 BAIAP2-225ENST00000576225 2316 ntTSL 218.06■□□□□ 0.484e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.474e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.444e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.414e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 EXD3-212ENST00000491734 2176 ntTSL 1 (best)17.62■□□□□ 0.414e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 CORO7-223ENST00000574311 1737 ntTSL 517.47■□□□□ 0.394e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 WDR74-212ENST00000541930 827 ntTSL 517.34■□□□□ 0.374e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 EXD3-210ENST00000487745 1992 ntTSL 217.31■□□□□ 0.364e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 NAE1-218ENST00000567743 1460 ntTSL 1 (best)17.29■□□□□ 0.364e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 PREB-208ENST00000468045 3057 ntTSL 217.08■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.324e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 CORO7-216ENST00000572549 663 ntTSL 517.05■□□□□ 0.324e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 WDR74-213ENST00000542347 988 ntTSL 216.98■□□□□ 0.314e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.284e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.274e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.264e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 CORO7-209ENST00000571756 1890 ntTSL 216.58■□□□□ 0.244e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.244e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.234e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 CORO7-230ENST00000576437 1066 ntTSL 516.48■□□□□ 0.234e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 WDR74-211ENST00000540620 984 ntTSL 316.3■□□□□ 0.24e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.184e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.184e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.164e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 CHERP-206ENST00000597261 674 ntTSL 216.01■□□□□ 0.153e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 CD151-221ENST00000532075 786 ntTSL 215.96■□□□□ 0.151e-7■■■■■ 40.5
RPS3P23396 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.144e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.144e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.113e-9■■■■■ 40.5
RPS3P23396 BAIAP2-210ENST00000572498 858 ntTSL 215.65■□□□□ 0.14e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.084e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 BAIAP2-209ENST00000572329 2133 ntTSL 215.47■□□□□ 0.074e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 ASL-208ENST00000488343 198 ntTSL 315.37■□□□□ 0.054e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.054e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 ASL-206ENST00000464970 640 ntTSL 315.33■□□□□ 0.044e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.043e-11■■■■■ 40.5
RPS3P23396 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -04e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.045e-7■■■■■ 40.5
RPS3P23396 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.054e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.074e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.074e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 TACC1-219ENST00000522474 635 ntTSL 314.31□□□□□ -0.123e-11■■■■■ 40.5
RPS3P23396 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.124e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.124e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.133e-9■■■■■ 40.5
RPS3P23396 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.151e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.164e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.194e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 EGLN3-208ENST00000551935 575 ntTSL 413.88□□□□□ -0.197e-9■■■■■ 40.5
RPS3P23396 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.234e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.244e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.254e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 LRP10-204ENST00000551466 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)13.41□□□□□ -0.261e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.294e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 TACC1-208ENST00000520340 1976 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.333e-11■■■■■ 40.5
RPS3P23396 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.354e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 BAIAP2-229ENST00000576995 3689 ntTSL 212.73□□□□□ -0.374e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.374e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 NOA1-201ENST00000264230 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.44e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 SEC23B-201ENST00000262544 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.413e-7■■■■■ 40.5
RPS3P23396 BAIAP2-222ENST00000575841 509 ntTSL 212.37□□□□□ -0.434e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 RREB1-208ENST00000483150 2833 ntTSL 1 (best)12.29□□□□□ -0.444e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 COX14-204ENST00000550654 580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.464e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 NIPSNAP1-203ENST00000437094 674 ntTSL 311.85□□□□□ -0.514e-8■■■■■ 40.5
RPS3P23396 ALDH1A2-208ENST00000558239 664 ntTSL 411.59□□□□□ -0.554e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 PREB-207ENST00000456259 1105 ntTSL 211.22□□□□□ -0.614e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 SEC23B-204ENST00000377475 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.653e-7■■■■■ 40.5
RPS3P23396 AC074032.1-201ENST00000548468 698 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.664e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 SEC23B-202ENST00000336714 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.673e-7■■■■■ 40.5
RPS3P23396 RRP7A-201ENST00000323013 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.684e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 LIPC-AS1-201ENST00000561083 2231 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.694e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 AC068533.4-201ENST00000450043 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.694e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 SEC23B-203ENST00000377465 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.73e-7■■■■■ 40.5
RPS3P23396 SCNM1-207ENST00000602841 749 ntTSL 310.67□□□□□ -0.74e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 CYFIP1-205ENST00000612288 553 ntTSL 310.25□□□□□ -0.775e-7■■■■■ 40.5
RPS3P23396 TNKS-201ENST00000310430 9620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.84e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 XPR1-202ENST00000367590 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.814e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 PRPS1-201ENST00000372418 942 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.834e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 TACC1-204ENST00000518415 3011 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.853e-11■■■■■ 40.5
RPS3P23396 WDR74-209ENST00000538150 487 ntTSL 39.71□□□□□ -0.864e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 ALDH1A2-222ENST00000560863 593 ntTSL 49.59□□□□□ -0.874e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 SCNM1-206ENST00000497147 862 ntTSL 29.56□□□□□ -0.884e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 CYFIP1-203ENST00000610365 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.895e-7■■■■■ 40.5
RPS3P23396 S100P-201ENST00000296370 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.899e-8■■■■■ 40.5
RPS3P23396 SEC23B-206ENST00000450074 1184 ntTSL 59.38□□□□□ -0.914e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 SCNM1-202ENST00000368905 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.934e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 NIPSNAP1-204ENST00000455496 600 ntTSL 39.07□□□□□ -0.964e-8■■■■■ 40.5
RPS3P23396 PREB-204ENST00000430533 615 ntTSL 29□□□□□ -0.974e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 TACC1-225ENST00000522983 572 ntTSL 48.76□□□□□ -1.013e-11■■■■■ 40.5
RPS3P23396 SCNM1-201ENST00000368902 869 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.044e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 NAE1-205ENST00000561579 728 ntTSL 58.49□□□□□ -1.054e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 AC074032.1-202ENST00000552815 467 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.074e-6■■■■■ 40.5
RPS3P23396 SCNM1-203ENST00000459799 619 ntTSL 28.23□□□□□ -1.094e-6■■■■■ 40.5
Retrieved 100 of 24,271 protein–RNA pairs in 572.9 ms