RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561083.1

LIPC-AS1-201, LIPC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LIPC-AS1, Length 2,231 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPC-AS1-201ENST00000561083 NISCHQ9Y2I1 1504 aa22.68■■□□□ 1.22
LIPC-AS1-201ENST00000561083 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa19.5■□□□□ 0.71
LIPC-AS1-201ENST00000561083 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP19.22■□□□□ 0.67
LIPC-AS1-201ENST00000561083 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa19.21■□□□□ 0.67
LIPC-AS1-201ENST00000561083 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
LIPC-AS1-201ENST00000561083 DCAF8L2P0C7V8 631 aa18.76■□□□□ 0.59
LIPC-AS1-201ENST00000561083 MYO15BQ96JP2 1530 aa18.72■□□□□ 0.59
LIPC-AS1-201ENST00000561083 CHIC1Q5VXU3 224 aa18.65■□□□□ 0.58
LIPC-AS1-201ENST00000561083 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa18.56■□□□□ 0.56
LIPC-AS1-201ENST00000561083 HRCP23327 699 aa18.27■□□□□ 0.52
LIPC-AS1-201ENST00000561083 PCGF6Q9BYE7 350 aa18.21■□□□□ 0.5
LIPC-AS1-201ENST00000561083 ABCC9O60706 1549 aa18.18■□□□□ 0.5
LIPC-AS1-201ENST00000561083 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa18.14■□□□□ 0.49
LIPC-AS1-201ENST00000561083 SCRIBQ14160 1630 aa18.1■□□□□ 0.49
LIPC-AS1-201ENST00000561083 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
LIPC-AS1-201ENST00000561083 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
LIPC-AS1-201ENST00000561083 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa17.91■□□□□ 0.46
LIPC-AS1-201ENST00000561083 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
LIPC-AS1-201ENST00000561083 TRIM41Q8WV44 630 aa17.75■□□□□ 0.43
LIPC-AS1-201ENST00000561083 CECR2Q9BXF3 1484 aa17.74■□□□□ 0.43
LIPC-AS1-201ENST00000561083 NACADO15069 1562 aa17.7■□□□□ 0.42
LIPC-AS1-201ENST00000561083 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP17.68■□□□□ 0.42
LIPC-AS1-201ENST00000561083 MROH2BQ7Z745 1585 aa17.68■□□□□ 0.42
LIPC-AS1-201ENST00000561083 WIZO95785 1651 aa17.62■□□□□ 0.41
LIPC-AS1-201ENST00000561083 EHMT2Q96KQ7 1210 aa17.57■□□□□ 0.4
LIPC-AS1-201ENST00000561083 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP17.47■□□□□ 0.39
LIPC-AS1-201ENST00000561083 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
LIPC-AS1-201ENST00000561083 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
LIPC-AS1-201ENST00000561083 ABCC8Q09428 1581 aa17.28■□□□□ 0.36
LIPC-AS1-201ENST00000561083 UNC13AQ9UPW8 1703 aa17.28■□□□□ 0.36
LIPC-AS1-201ENST00000561083 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
LIPC-AS1-201ENST00000561083 SMARCA4P51532 1647 aa17.27■□□□□ 0.36
LIPC-AS1-201ENST00000561083 CCDC88BA6NC98 1476 aa17.23■□□□□ 0.35
LIPC-AS1-201ENST00000561083 SMARCA2P51531 1590 aa17.22■□□□□ 0.35
LIPC-AS1-201ENST00000561083 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
LIPC-AS1-201ENST00000561083 SOGA1O94964 1423 aa17.11■□□□□ 0.33
LIPC-AS1-201ENST00000561083 CEP162Q5TB80 1403 aa17.06■□□□□ 0.32
LIPC-AS1-201ENST00000561083 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa17.06■□□□□ 0.32
LIPC-AS1-201ENST00000561083 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP17.04■□□□□ 0.32
LIPC-AS1-201ENST00000561083 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
LIPC-AS1-201ENST00000561083 BICRAQ9NZM4 1560 aa17.01■□□□□ 0.31
LIPC-AS1-201ENST00000561083 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
LIPC-AS1-201ENST00000561083 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP16.99■□□□□ 0.31
LIPC-AS1-201ENST00000561083 TNIKQ9UKE5 1360 aa16.98■□□□□ 0.31
LIPC-AS1-201ENST00000561083 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
LIPC-AS1-201ENST00000561083 CSRNP3Q8WYN3 585 aa16.94■□□□□ 0.3
LIPC-AS1-201ENST00000561083 EEA1Q15075 1411 aa16.92■□□□□ 0.3
LIPC-AS1-201ENST00000561083 PEG3Q9GZU2 1588 aa16.9■□□□□ 0.3
LIPC-AS1-201ENST00000561083 UBTFP17480 764 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
LIPC-AS1-201ENST00000561083 SYNJ1O43426 1573 aa16.88■□□□□ 0.29
LIPC-AS1-201ENST00000561083 GOLGA3Q08378 1498 aa16.87■□□□□ 0.29
LIPC-AS1-201ENST00000561083 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa16.77■□□□□ 0.28
LIPC-AS1-201ENST00000561083 KIF21BO75037 1637 aa16.77■□□□□ 0.28
LIPC-AS1-201ENST00000561083 CEP164Q9UPV0 1460 aa16.75■□□□□ 0.27
LIPC-AS1-201ENST00000561083 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
LIPC-AS1-201ENST00000561083 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
LIPC-AS1-201ENST00000561083 NEUROD1Q13562 356 aa16.72■□□□□ 0.27
LIPC-AS1-201ENST00000561083 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
LIPC-AS1-201ENST00000561083 CLIP1P30622 1438 aa16.69■□□□□ 0.26
LIPC-AS1-201ENST00000561083 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa16.68■□□□□ 0.26
LIPC-AS1-201ENST00000561083 VPS8Q8N3P4 1428 aa16.64■□□□□ 0.25
LIPC-AS1-201ENST00000561083 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
LIPC-AS1-201ENST00000561083 TOP2BQ02880 1626 aa16.61■□□□□ 0.25
LIPC-AS1-201ENST00000561083 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
LIPC-AS1-201ENST00000561083 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.25
LIPC-AS1-201ENST00000561083 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa16.55■□□□□ 0.24
LIPC-AS1-201ENST00000561083 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
LIPC-AS1-201ENST00000561083 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa16.53■□□□□ 0.24
LIPC-AS1-201ENST00000561083 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
LIPC-AS1-201ENST00000561083 APLP2Q06481 763 aa16.47■□□□□ 0.23
LIPC-AS1-201ENST00000561083 PRXQ9BXM0 1461 aa16.47■□□□□ 0.23
LIPC-AS1-201ENST00000561083 ARAP1Q96P48 1450 aa16.46■□□□□ 0.23
LIPC-AS1-201ENST00000561083 ERICH3Q5RHP9 1530 aa16.46■□□□□ 0.23
LIPC-AS1-201ENST00000561083 CUX1P39880 1505 aa16.45■□□□□ 0.22
LIPC-AS1-201ENST00000561083 MIER1Q8N108 512 aa16.42■□□□□ 0.22
LIPC-AS1-201ENST00000561083 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
LIPC-AS1-201ENST00000561083 HMGXB3Q12766 1538 aa16.41■□□□□ 0.22
LIPC-AS1-201ENST00000561083 NCAPD3P42695 1498 aa16.39■□□□□ 0.21
LIPC-AS1-201ENST00000561083 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
LIPC-AS1-201ENST00000561083 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
LIPC-AS1-201ENST00000561083 KIF27Q86VH2 1401 aa16.32■□□□□ 0.2
LIPC-AS1-201ENST00000561083 CFTRP13569 1480 aa16.32■□□□□ 0.2
LIPC-AS1-201ENST00000561083 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa16.29■□□□□ 0.2
LIPC-AS1-201ENST00000561083 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
LIPC-AS1-201ENST00000561083 PRDM2Q13029 1718 aa16.23■□□□□ 0.19
LIPC-AS1-201ENST00000561083 CLSPNQ9HAW4 1339 aa16.23■□□□□ 0.19
LIPC-AS1-201ENST00000561083 CUX2O14529 1486 aa16.19■□□□□ 0.18
LIPC-AS1-201ENST00000561083 CCNB3Q8WWL7 1395 aa16.19■□□□□ 0.18
LIPC-AS1-201ENST00000561083 IGF1RP08069 1367 aa16.17■□□□□ 0.18
LIPC-AS1-201ENST00000561083 ITGAEP38570 1179 aa16.15■□□□□ 0.18
LIPC-AS1-201ENST00000561083 TIAM1Q13009 1591 aa16.12■□□□□ 0.17
LIPC-AS1-201ENST00000561083 FGD5Q6ZNL6 1462 aa16.12■□□□□ 0.17
LIPC-AS1-201ENST00000561083 MAPKBP1O60336 1514 aa16.09■□□□□ 0.17
LIPC-AS1-201ENST00000561083 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa16.08■□□□□ 0.17
LIPC-AS1-201ENST00000561083 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa16.08■□□□□ 0.17
LIPC-AS1-201ENST00000561083 CADPSQ9ULU8 1353 aa16.08■□□□□ 0.17
LIPC-AS1-201ENST00000561083 MAP3K1Q13233 1512 aa16.05■□□□□ 0.16
LIPC-AS1-201ENST00000561083 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa16.04■□□□□ 0.16
LIPC-AS1-201ENST00000561083 PHLDB1Q86UU1 1377 aa16.04■□□□□ 0.16
LIPC-AS1-201ENST00000561083 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 160.9 ms