Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFNA1P20827 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFNA1P20827 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFNA1P20827 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFNA1P20827 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EFNA1P20827 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFNA1P20827 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFNA1P20827 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFNA1P20827 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFNA1P20827 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFNA1P20827 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFNA1P20827 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFNA1P20827 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFNA1P20827 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFNA1P20827 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFNA1P20827 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFNA1P20827 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFNA1P20827 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFNA1P20827 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFNA1P20827 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFNA1P20827 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFNA1P20827 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFNA1P20827 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFNA1P20827 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFNA1P20827 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFNA1P20827 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFNA1P20827 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFNA1P20827 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFNA1P20827 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFNA1P20827 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFNA1P20827 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFNA1P20827 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFNA1P20827 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFNA1P20827 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFNA1P20827 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFNA1P20827 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFNA1P20827 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFNA1P20827 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EFNA1P20827 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EFNA1P20827 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EFNA1P20827 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EFNA1P20827 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EFNA1P20827 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFNA1P20827 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFNA1P20827 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFNA1P20827 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFNA1P20827 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFNA1P20827 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFNA1P20827 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFNA1P20827 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EFNA1P20827 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFNA1P20827 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFNA1P20827 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFNA1P20827 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFNA1P20827 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFNA1P20827 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFNA1P20827 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EFNA1P20827 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFNA1P20827 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFNA1P20827 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
EFNA1P20827 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFNA1P20827 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFNA1P20827 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
EFNA1P20827 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFNA1P20827 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFNA1P20827 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EFNA1P20827 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFNA1P20827 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFNA1P20827 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFNA1P20827 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFNA1P20827 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFNA1P20827 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFNA1P20827 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EFNA1P20827 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFNA1P20827 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFNA1P20827 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFNA1P20827 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EFNA1P20827 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EFNA1P20827 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EFNA1P20827 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EFNA1P20827 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EFNA1P20827 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EFNA1P20827 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EFNA1P20827 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EFNA1P20827 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EFNA1P20827 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
EFNA1P20827 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EFNA1P20827 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EFNA1P20827 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
EFNA1P20827 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EFNA1P20827 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFNA1P20827 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFNA1P20827 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFNA1P20827 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFNA1P20827 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFNA1P20827 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EFNA1P20827 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFNA1P20827 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EFNA1P20827 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
EFNA1P20827 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms