Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LMNB1P20700 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LMNB1P20700 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
LMNB1P20700 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
LMNB1P20700 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
LMNB1P20700 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LMNB1P20700 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
LMNB1P20700 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LMNB1P20700 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LMNB1P20700 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
LMNB1P20700 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LMNB1P20700 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LMNB1P20700 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LMNB1P20700 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
LMNB1P20700 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LMNB1P20700 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LMNB1P20700 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LMNB1P20700 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LMNB1P20700 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LMNB1P20700 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
LMNB1P20700 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
LMNB1P20700 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
LMNB1P20700 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LMNB1P20700 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LMNB1P20700 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LMNB1P20700 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LMNB1P20700 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LMNB1P20700 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LMNB1P20700 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LMNB1P20700 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LMNB1P20700 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LMNB1P20700 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LMNB1P20700 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
LMNB1P20700 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LMNB1P20700 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LMNB1P20700 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LMNB1P20700 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LMNB1P20700 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LMNB1P20700 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LMNB1P20700 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
LMNB1P20700 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LMNB1P20700 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LMNB1P20700 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
LMNB1P20700 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
LMNB1P20700 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LMNB1P20700 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LMNB1P20700 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
LMNB1P20700 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LMNB1P20700 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LMNB1P20700 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
LMNB1P20700 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
LMNB1P20700 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LMNB1P20700 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
LMNB1P20700 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
LMNB1P20700 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
LMNB1P20700 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
LMNB1P20700 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
LMNB1P20700 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
LMNB1P20700 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LMNB1P20700 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
LMNB1P20700 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
LMNB1P20700 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
LMNB1P20700 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
LMNB1P20700 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
LMNB1P20700 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LMNB1P20700 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LMNB1P20700 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
LMNB1P20700 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LMNB1P20700 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LMNB1P20700 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LMNB1P20700 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LMNB1P20700 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LMNB1P20700 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LMNB1P20700 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LMNB1P20700 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LMNB1P20700 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LMNB1P20700 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LMNB1P20700 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
LMNB1P20700 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LMNB1P20700 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LMNB1P20700 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
LMNB1P20700 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LMNB1P20700 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LMNB1P20700 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
LMNB1P20700 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
LMNB1P20700 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.39
LMNB1P20700 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
LMNB1P20700 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
LMNB1P20700 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LMNB1P20700 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LMNB1P20700 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
LMNB1P20700 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LMNB1P20700 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LMNB1P20700 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LMNB1P20700 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LMNB1P20700 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LMNB1P20700 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LMNB1P20700 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LMNB1P20700 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LMNB1P20700 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms