Protein–RNA interactions for Protein: P20061

TCN1, Transcobalamin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCN1P20061 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCN1P20061 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCN1P20061 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCN1P20061 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCN1P20061 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCN1P20061 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCN1P20061 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCN1P20061 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCN1P20061 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCN1P20061 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCN1P20061 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCN1P20061 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCN1P20061 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TCN1P20061 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCN1P20061 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCN1P20061 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TCN1P20061 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCN1P20061 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCN1P20061 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCN1P20061 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCN1P20061 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCN1P20061 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCN1P20061 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCN1P20061 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCN1P20061 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TCN1P20061 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCN1P20061 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCN1P20061 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCN1P20061 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCN1P20061 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TCN1P20061 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCN1P20061 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TCN1P20061 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCN1P20061 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TCN1P20061 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TCN1P20061 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCN1P20061 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCN1P20061 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCN1P20061 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TCN1P20061 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCN1P20061 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCN1P20061 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCN1P20061 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TCN1P20061 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCN1P20061 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCN1P20061 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCN1P20061 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCN1P20061 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCN1P20061 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCN1P20061 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TCN1P20061 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCN1P20061 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCN1P20061 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCN1P20061 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCN1P20061 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCN1P20061 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCN1P20061 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCN1P20061 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCN1P20061 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCN1P20061 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCN1P20061 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCN1P20061 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCN1P20061 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCN1P20061 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCN1P20061 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCN1P20061 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCN1P20061 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCN1P20061 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCN1P20061 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCN1P20061 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCN1P20061 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCN1P20061 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCN1P20061 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCN1P20061 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCN1P20061 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCN1P20061 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCN1P20061 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCN1P20061 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCN1P20061 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCN1P20061 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCN1P20061 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCN1P20061 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TCN1P20061 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCN1P20061 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCN1P20061 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCN1P20061 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCN1P20061 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCN1P20061 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCN1P20061 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCN1P20061 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCN1P20061 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCN1P20061 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TCN1P20061 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCN1P20061 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCN1P20061 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCN1P20061 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCN1P20061 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCN1P20061 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCN1P20061 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCN1P20061 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.8 ms