Protein–RNA interactions for Protein: P18887

XRCC1, DNA repair protein XRCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC1P18887 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
XRCC1P18887 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
XRCC1P18887 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XRCC1P18887 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
XRCC1P18887 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XRCC1P18887 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XRCC1P18887 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
XRCC1P18887 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
XRCC1P18887 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
XRCC1P18887 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
XRCC1P18887 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XRCC1P18887 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XRCC1P18887 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
XRCC1P18887 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XRCC1P18887 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XRCC1P18887 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
XRCC1P18887 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
XRCC1P18887 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
XRCC1P18887 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XRCC1P18887 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XRCC1P18887 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
XRCC1P18887 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XRCC1P18887 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
XRCC1P18887 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
XRCC1P18887 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
XRCC1P18887 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
XRCC1P18887 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
XRCC1P18887 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XRCC1P18887 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XRCC1P18887 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XRCC1P18887 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XRCC1P18887 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XRCC1P18887 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XRCC1P18887 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XRCC1P18887 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
XRCC1P18887 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
XRCC1P18887 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
XRCC1P18887 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
XRCC1P18887 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
XRCC1P18887 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
XRCC1P18887 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
XRCC1P18887 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
XRCC1P18887 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
XRCC1P18887 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
XRCC1P18887 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
XRCC1P18887 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XRCC1P18887 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XRCC1P18887 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XRCC1P18887 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XRCC1P18887 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
XRCC1P18887 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
XRCC1P18887 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XRCC1P18887 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
XRCC1P18887 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XRCC1P18887 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
XRCC1P18887 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
XRCC1P18887 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XRCC1P18887 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
XRCC1P18887 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XRCC1P18887 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
XRCC1P18887 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
XRCC1P18887 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XRCC1P18887 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
XRCC1P18887 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
XRCC1P18887 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XRCC1P18887 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
XRCC1P18887 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XRCC1P18887 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XRCC1P18887 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
XRCC1P18887 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
XRCC1P18887 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XRCC1P18887 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XRCC1P18887 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
XRCC1P18887 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
XRCC1P18887 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XRCC1P18887 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
XRCC1P18887 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XRCC1P18887 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XRCC1P18887 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XRCC1P18887 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XRCC1P18887 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XRCC1P18887 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XRCC1P18887 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XRCC1P18887 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XRCC1P18887 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
XRCC1P18887 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
XRCC1P18887 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
XRCC1P18887 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XRCC1P18887 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XRCC1P18887 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XRCC1P18887 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
XRCC1P18887 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
XRCC1P18887 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XRCC1P18887 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
XRCC1P18887 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XRCC1P18887 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XRCC1P18887 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XRCC1P18887 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
XRCC1P18887 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XRCC1P18887 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms