Protein–RNA interactions for Protein: P17948

FLT1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT1P17948 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
FLT1P17948 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
FLT1P17948 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
FLT1P17948 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FLT1P17948 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FLT1P17948 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FLT1P17948 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
FLT1P17948 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FLT1P17948 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FLT1P17948 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FLT1P17948 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FLT1P17948 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FLT1P17948 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FLT1P17948 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FLT1P17948 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
FLT1P17948 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FLT1P17948 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FLT1P17948 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FLT1P17948 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
FLT1P17948 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FLT1P17948 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FLT1P17948 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FLT1P17948 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FLT1P17948 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FLT1P17948 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FLT1P17948 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FLT1P17948 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
FLT1P17948 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FLT1P17948 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FLT1P17948 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
FLT1P17948 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FLT1P17948 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
FLT1P17948 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
FLT1P17948 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
FLT1P17948 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
FLT1P17948 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FLT1P17948 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FLT1P17948 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FLT1P17948 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
FLT1P17948 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FLT1P17948 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FLT1P17948 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FLT1P17948 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
FLT1P17948 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FLT1P17948 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FLT1P17948 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FLT1P17948 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FLT1P17948 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FLT1P17948 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FLT1P17948 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FLT1P17948 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FLT1P17948 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FLT1P17948 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FLT1P17948 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
FLT1P17948 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FLT1P17948 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FLT1P17948 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FLT1P17948 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FLT1P17948 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
FLT1P17948 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FLT1P17948 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FLT1P17948 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
FLT1P17948 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FLT1P17948 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FLT1P17948 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
FLT1P17948 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
FLT1P17948 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FLT1P17948 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FLT1P17948 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FLT1P17948 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FLT1P17948 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FLT1P17948 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FLT1P17948 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FLT1P17948 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
FLT1P17948 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
FLT1P17948 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FLT1P17948 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FLT1P17948 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FLT1P17948 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FLT1P17948 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
FLT1P17948 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FLT1P17948 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FLT1P17948 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FLT1P17948 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FLT1P17948 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FLT1P17948 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FLT1P17948 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FLT1P17948 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FLT1P17948 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
FLT1P17948 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
FLT1P17948 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
FLT1P17948 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
FLT1P17948 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
FLT1P17948 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
FLT1P17948 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
FLT1P17948 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
FLT1P17948 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
FLT1P17948 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
FLT1P17948 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
FLT1P17948 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms