Protein–RNA interactions for Protein: P17540

CKMT2, Creatine kinase S-type, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMT2P17540 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CKMT2P17540 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CKMT2P17540 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CKMT2P17540 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CKMT2P17540 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CKMT2P17540 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CKMT2P17540 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CKMT2P17540 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CKMT2P17540 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CKMT2P17540 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CKMT2P17540 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CKMT2P17540 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CKMT2P17540 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CKMT2P17540 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CKMT2P17540 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CKMT2P17540 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CKMT2P17540 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CKMT2P17540 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CKMT2P17540 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CKMT2P17540 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CKMT2P17540 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CKMT2P17540 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CKMT2P17540 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CKMT2P17540 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CKMT2P17540 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CKMT2P17540 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CKMT2P17540 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CKMT2P17540 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CKMT2P17540 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CKMT2P17540 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CKMT2P17540 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CKMT2P17540 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CKMT2P17540 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CKMT2P17540 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CKMT2P17540 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CKMT2P17540 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CKMT2P17540 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CKMT2P17540 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CKMT2P17540 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CKMT2P17540 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CKMT2P17540 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CKMT2P17540 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CKMT2P17540 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CKMT2P17540 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CKMT2P17540 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CKMT2P17540 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CKMT2P17540 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CKMT2P17540 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CKMT2P17540 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CKMT2P17540 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CKMT2P17540 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CKMT2P17540 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CKMT2P17540 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CKMT2P17540 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CKMT2P17540 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CKMT2P17540 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CKMT2P17540 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CKMT2P17540 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CKMT2P17540 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CKMT2P17540 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CKMT2P17540 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CKMT2P17540 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CKMT2P17540 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CKMT2P17540 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CKMT2P17540 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CKMT2P17540 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CKMT2P17540 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CKMT2P17540 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CKMT2P17540 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CKMT2P17540 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CKMT2P17540 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CKMT2P17540 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CKMT2P17540 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CKMT2P17540 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CKMT2P17540 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CKMT2P17540 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CKMT2P17540 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CKMT2P17540 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CKMT2P17540 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CKMT2P17540 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CKMT2P17540 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CKMT2P17540 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CKMT2P17540 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CKMT2P17540 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CKMT2P17540 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CKMT2P17540 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CKMT2P17540 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CKMT2P17540 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CKMT2P17540 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CKMT2P17540 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CKMT2P17540 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CKMT2P17540 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CKMT2P17540 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CKMT2P17540 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CKMT2P17540 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CKMT2P17540 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CKMT2P17540 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CKMT2P17540 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CKMT2P17540 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CKMT2P17540 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms