Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CD44P16070 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CD44P16070 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CD44P16070 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CD44P16070 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CD44P16070 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CD44P16070 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CD44P16070 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CD44P16070 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CD44P16070 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CD44P16070 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CD44P16070 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CD44P16070 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CD44P16070 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CD44P16070 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CD44P16070 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CD44P16070 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CD44P16070 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CD44P16070 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CD44P16070 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CD44P16070 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CD44P16070 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CD44P16070 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CD44P16070 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CD44P16070 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CD44P16070 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CD44P16070 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CD44P16070 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CD44P16070 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CD44P16070 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CD44P16070 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CD44P16070 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CD44P16070 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CD44P16070 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CD44P16070 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CD44P16070 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CD44P16070 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CD44P16070 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CD44P16070 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CD44P16070 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CD44P16070 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CD44P16070 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CD44P16070 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CD44P16070 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CD44P16070 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CD44P16070 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CD44P16070 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CD44P16070 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CD44P16070 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CD44P16070 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CD44P16070 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CD44P16070 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CD44P16070 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CD44P16070 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CD44P16070 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CD44P16070 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CD44P16070 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CD44P16070 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CD44P16070 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CD44P16070 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CD44P16070 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CD44P16070 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CD44P16070 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CD44P16070 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CD44P16070 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CD44P16070 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CD44P16070 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CD44P16070 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CD44P16070 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CD44P16070 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CD44P16070 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CD44P16070 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CD44P16070 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CD44P16070 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CD44P16070 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CD44P16070 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CD44P16070 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CD44P16070 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CD44P16070 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CD44P16070 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CD44P16070 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CD44P16070 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CD44P16070 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CD44P16070 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CD44P16070 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CD44P16070 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CD44P16070 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CD44P16070 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CD44P16070 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CD44P16070 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CD44P16070 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CD44P16070 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CD44P16070 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CD44P16070 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CD44P16070 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CD44P16070 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CD44P16070 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CD44P16070 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CD44P16070 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CD44P16070 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms