Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPGDP15428 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPGDP15428 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPGDP15428 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPGDP15428 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HPGDP15428 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPGDP15428 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPGDP15428 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPGDP15428 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPGDP15428 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPGDP15428 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPGDP15428 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPGDP15428 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPGDP15428 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPGDP15428 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPGDP15428 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPGDP15428 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPGDP15428 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPGDP15428 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPGDP15428 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPGDP15428 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPGDP15428 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPGDP15428 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPGDP15428 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPGDP15428 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPGDP15428 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPGDP15428 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPGDP15428 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HPGDP15428 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPGDP15428 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPGDP15428 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPGDP15428 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPGDP15428 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPGDP15428 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPGDP15428 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPGDP15428 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPGDP15428 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPGDP15428 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPGDP15428 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPGDP15428 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPGDP15428 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPGDP15428 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPGDP15428 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPGDP15428 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPGDP15428 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HPGDP15428 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPGDP15428 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPGDP15428 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPGDP15428 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPGDP15428 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPGDP15428 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPGDP15428 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPGDP15428 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPGDP15428 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPGDP15428 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPGDP15428 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPGDP15428 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPGDP15428 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HPGDP15428 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HPGDP15428 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPGDP15428 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPGDP15428 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPGDP15428 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPGDP15428 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPGDP15428 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPGDP15428 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPGDP15428 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HPGDP15428 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPGDP15428 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPGDP15428 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HPGDP15428 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPGDP15428 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPGDP15428 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPGDP15428 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPGDP15428 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPGDP15428 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPGDP15428 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPGDP15428 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPGDP15428 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPGDP15428 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPGDP15428 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPGDP15428 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HPGDP15428 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPGDP15428 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPGDP15428 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPGDP15428 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPGDP15428 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HPGDP15428 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HPGDP15428 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPGDP15428 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPGDP15428 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPGDP15428 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HPGDP15428 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPGDP15428 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPGDP15428 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPGDP15428 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPGDP15428 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPGDP15428 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HPGDP15428 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HPGDP15428 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms