Protein–RNA interactions for Protein: P15328

FOLR1, Folate receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOLR1P15328 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FOLR1P15328 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FOLR1P15328 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOLR1P15328 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOLR1P15328 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOLR1P15328 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOLR1P15328 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOLR1P15328 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOLR1P15328 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOLR1P15328 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FOLR1P15328 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOLR1P15328 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOLR1P15328 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOLR1P15328 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOLR1P15328 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOLR1P15328 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOLR1P15328 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOLR1P15328 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOLR1P15328 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOLR1P15328 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOLR1P15328 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FOLR1P15328 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOLR1P15328 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOLR1P15328 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOLR1P15328 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOLR1P15328 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOLR1P15328 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOLR1P15328 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOLR1P15328 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FOLR1P15328 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOLR1P15328 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOLR1P15328 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOLR1P15328 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOLR1P15328 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOLR1P15328 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOLR1P15328 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOLR1P15328 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOLR1P15328 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOLR1P15328 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOLR1P15328 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOLR1P15328 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOLR1P15328 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOLR1P15328 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOLR1P15328 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOLR1P15328 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOLR1P15328 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOLR1P15328 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOLR1P15328 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOLR1P15328 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOLR1P15328 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOLR1P15328 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FOLR1P15328 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOLR1P15328 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOLR1P15328 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOLR1P15328 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOLR1P15328 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOLR1P15328 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOLR1P15328 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FOLR1P15328 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOLR1P15328 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOLR1P15328 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOLR1P15328 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOLR1P15328 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOLR1P15328 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOLR1P15328 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOLR1P15328 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOLR1P15328 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOLR1P15328 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOLR1P15328 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOLR1P15328 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOLR1P15328 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FOLR1P15328 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOLR1P15328 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOLR1P15328 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOLR1P15328 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOLR1P15328 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOLR1P15328 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOLR1P15328 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FOLR1P15328 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOLR1P15328 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOLR1P15328 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FOLR1P15328 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOLR1P15328 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOLR1P15328 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOLR1P15328 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOLR1P15328 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOLR1P15328 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOLR1P15328 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOLR1P15328 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOLR1P15328 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOLR1P15328 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOLR1P15328 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOLR1P15328 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOLR1P15328 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOLR1P15328 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOLR1P15328 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOLR1P15328 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOLR1P15328 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOLR1P15328 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOLR1P15328 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms