Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRG2P13727 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRG2P13727 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRG2P13727 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRG2P13727 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRG2P13727 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRG2P13727 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRG2P13727 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRG2P13727 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRG2P13727 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRG2P13727 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRG2P13727 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRG2P13727 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRG2P13727 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRG2P13727 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRG2P13727 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRG2P13727 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRG2P13727 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRG2P13727 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRG2P13727 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRG2P13727 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRG2P13727 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRG2P13727 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRG2P13727 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRG2P13727 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRG2P13727 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRG2P13727 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRG2P13727 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRG2P13727 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRG2P13727 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRG2P13727 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRG2P13727 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRG2P13727 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRG2P13727 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRG2P13727 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRG2P13727 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRG2P13727 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRG2P13727 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRG2P13727 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRG2P13727 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRG2P13727 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRG2P13727 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRG2P13727 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRG2P13727 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRG2P13727 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRG2P13727 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRG2P13727 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRG2P13727 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRG2P13727 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRG2P13727 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRG2P13727 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRG2P13727 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRG2P13727 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRG2P13727 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRG2P13727 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRG2P13727 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRG2P13727 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRG2P13727 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRG2P13727 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRG2P13727 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRG2P13727 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRG2P13727 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRG2P13727 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRG2P13727 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRG2P13727 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRG2P13727 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRG2P13727 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRG2P13727 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRG2P13727 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRG2P13727 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRG2P13727 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRG2P13727 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRG2P13727 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRG2P13727 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRG2P13727 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRG2P13727 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRG2P13727 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRG2P13727 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRG2P13727 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRG2P13727 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRG2P13727 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRG2P13727 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRG2P13727 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRG2P13727 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRG2P13727 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRG2P13727 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRG2P13727 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PRG2P13727 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRG2P13727 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRG2P13727 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRG2P13727 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRG2P13727 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRG2P13727 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRG2P13727 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRG2P13727 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRG2P13727 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRG2P13727 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRG2P13727 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRG2P13727 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRG2P13727 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms