Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TPRP12270 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPRP12270 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPRP12270 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPRP12270 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPRP12270 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPRP12270 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPRP12270 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPRP12270 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TPRP12270 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPRP12270 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPRP12270 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPRP12270 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPRP12270 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TPRP12270 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPRP12270 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPRP12270 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPRP12270 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPRP12270 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TPRP12270 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPRP12270 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPRP12270 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPRP12270 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPRP12270 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPRP12270 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPRP12270 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TPRP12270 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPRP12270 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPRP12270 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPRP12270 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPRP12270 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPRP12270 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TPRP12270 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPRP12270 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPRP12270 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPRP12270 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPRP12270 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TPRP12270 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPRP12270 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPRP12270 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPRP12270 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPRP12270 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPRP12270 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPRP12270 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPRP12270 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPRP12270 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPRP12270 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPRP12270 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPRP12270 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPRP12270 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPRP12270 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPRP12270 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TPRP12270 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPRP12270 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TPRP12270 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPRP12270 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPRP12270 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPRP12270 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPRP12270 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPRP12270 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPRP12270 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TPRP12270 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPRP12270 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPRP12270 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPRP12270 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPRP12270 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPRP12270 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPRP12270 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPRP12270 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TPRP12270 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPRP12270 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPRP12270 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPRP12270 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPRP12270 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TPRP12270 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPRP12270 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TPRP12270 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPRP12270 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPRP12270 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPRP12270 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPRP12270 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TPRP12270 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPRP12270 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TPRP12270 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPRP12270 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPRP12270 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPRP12270 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPRP12270 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPRP12270 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPRP12270 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPRP12270 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPRP12270 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPRP12270 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPRP12270 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPRP12270 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPRP12270 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPRP12270 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPRP12270 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPRP12270 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPRP12270 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms