Protein–RNA interactions for Protein: P11487

FGF3, Fibroblast growth factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF3P11487 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGF3P11487 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGF3P11487 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGF3P11487 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FGF3P11487 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FGF3P11487 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGF3P11487 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGF3P11487 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGF3P11487 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FGF3P11487 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FGF3P11487 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FGF3P11487 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FGF3P11487 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FGF3P11487 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FGF3P11487 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FGF3P11487 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FGF3P11487 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FGF3P11487 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGF3P11487 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGF3P11487 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGF3P11487 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGF3P11487 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGF3P11487 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGF3P11487 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGF3P11487 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGF3P11487 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FGF3P11487 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGF3P11487 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGF3P11487 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGF3P11487 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGF3P11487 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGF3P11487 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FGF3P11487 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGF3P11487 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGF3P11487 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGF3P11487 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGF3P11487 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FGF3P11487 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGF3P11487 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGF3P11487 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGF3P11487 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FGF3P11487 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FGF3P11487 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGF3P11487 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGF3P11487 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FGF3P11487 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGF3P11487 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FGF3P11487 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGF3P11487 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FGF3P11487 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGF3P11487 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FGF3P11487 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGF3P11487 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGF3P11487 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGF3P11487 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGF3P11487 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FGF3P11487 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGF3P11487 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGF3P11487 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGF3P11487 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGF3P11487 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGF3P11487 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGF3P11487 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGF3P11487 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGF3P11487 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGF3P11487 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGF3P11487 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGF3P11487 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGF3P11487 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGF3P11487 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGF3P11487 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGF3P11487 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGF3P11487 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGF3P11487 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGF3P11487 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGF3P11487 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGF3P11487 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGF3P11487 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGF3P11487 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGF3P11487 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGF3P11487 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGF3P11487 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGF3P11487 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGF3P11487 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGF3P11487 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FGF3P11487 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGF3P11487 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FGF3P11487 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGF3P11487 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGF3P11487 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGF3P11487 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGF3P11487 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGF3P11487 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGF3P11487 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGF3P11487 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FGF3P11487 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGF3P11487 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGF3P11487 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGF3P11487 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGF3P11487 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms