Protein–RNA interactions for Protein: P11277

SPTB, Spectrin beta chain, erythrocytic, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBP11277 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPTBP11277 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPTBP11277 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPTBP11277 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPTBP11277 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPTBP11277 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPTBP11277 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPTBP11277 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPTBP11277 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SPTBP11277 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPTBP11277 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPTBP11277 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPTBP11277 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPTBP11277 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPTBP11277 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPTBP11277 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPTBP11277 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SPTBP11277 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPTBP11277 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPTBP11277 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPTBP11277 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SPTBP11277 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPTBP11277 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPTBP11277 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPTBP11277 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPTBP11277 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPTBP11277 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPTBP11277 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPTBP11277 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPTBP11277 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPTBP11277 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPTBP11277 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPTBP11277 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPTBP11277 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPTBP11277 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SPTBP11277 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPTBP11277 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPTBP11277 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPTBP11277 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPTBP11277 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPTBP11277 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPTBP11277 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPTBP11277 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPTBP11277 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPTBP11277 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPTBP11277 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPTBP11277 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTBP11277 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTBP11277 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTBP11277 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTBP11277 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTBP11277 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTBP11277 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTBP11277 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPTBP11277 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTBP11277 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTBP11277 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTBP11277 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTBP11277 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTBP11277 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPTBP11277 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTBP11277 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPTBP11277 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPTBP11277 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPTBP11277 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPTBP11277 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPTBP11277 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTBP11277 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTBP11277 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTBP11277 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTBP11277 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTBP11277 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTBP11277 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPTBP11277 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTBP11277 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTBP11277 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTBP11277 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTBP11277 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTBP11277 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPTBP11277 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTBP11277 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTBP11277 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTBP11277 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTBP11277 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTBP11277 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTBP11277 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTBP11277 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTBP11277 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTBP11277 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPTBP11277 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTBP11277 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTBP11277 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTBP11277 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTBP11277 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTBP11277 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPTBP11277 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPTBP11277 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPTBP11277 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPTBP11277 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPTBP11277 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms