Protein–RNA interactions for Protein: P11172

UMPS, Uridine 5'-monophosphate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UMPSP11172 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UMPSP11172 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UMPSP11172 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UMPSP11172 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UMPSP11172 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UMPSP11172 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UMPSP11172 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UMPSP11172 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UMPSP11172 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UMPSP11172 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UMPSP11172 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UMPSP11172 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UMPSP11172 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UMPSP11172 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UMPSP11172 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UMPSP11172 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
UMPSP11172 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UMPSP11172 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UMPSP11172 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UMPSP11172 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UMPSP11172 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UMPSP11172 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UMPSP11172 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UMPSP11172 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UMPSP11172 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UMPSP11172 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UMPSP11172 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UMPSP11172 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UMPSP11172 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UMPSP11172 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UMPSP11172 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UMPSP11172 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UMPSP11172 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UMPSP11172 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
UMPSP11172 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UMPSP11172 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UMPSP11172 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UMPSP11172 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UMPSP11172 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UMPSP11172 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UMPSP11172 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UMPSP11172 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UMPSP11172 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UMPSP11172 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UMPSP11172 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UMPSP11172 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UMPSP11172 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UMPSP11172 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UMPSP11172 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UMPSP11172 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UMPSP11172 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UMPSP11172 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UMPSP11172 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UMPSP11172 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UMPSP11172 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UMPSP11172 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UMPSP11172 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UMPSP11172 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UMPSP11172 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UMPSP11172 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UMPSP11172 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UMPSP11172 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UMPSP11172 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UMPSP11172 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UMPSP11172 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UMPSP11172 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UMPSP11172 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UMPSP11172 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UMPSP11172 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UMPSP11172 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UMPSP11172 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UMPSP11172 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UMPSP11172 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UMPSP11172 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UMPSP11172 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UMPSP11172 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UMPSP11172 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UMPSP11172 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UMPSP11172 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UMPSP11172 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UMPSP11172 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UMPSP11172 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UMPSP11172 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UMPSP11172 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UMPSP11172 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UMPSP11172 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UMPSP11172 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UMPSP11172 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UMPSP11172 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
UMPSP11172 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UMPSP11172 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UMPSP11172 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UMPSP11172 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UMPSP11172 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UMPSP11172 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UMPSP11172 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UMPSP11172 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UMPSP11172 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UMPSP11172 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UMPSP11172 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms