Protein–RNA interactions for Protein: P10276

RARA, Retinoic acid receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARAP10276 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RARAP10276 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RARAP10276 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RARAP10276 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RARAP10276 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RARAP10276 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RARAP10276 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RARAP10276 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RARAP10276 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RARAP10276 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RARAP10276 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RARAP10276 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RARAP10276 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RARAP10276 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RARAP10276 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RARAP10276 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RARAP10276 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RARAP10276 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RARAP10276 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RARAP10276 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RARAP10276 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RARAP10276 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RARAP10276 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RARAP10276 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RARAP10276 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RARAP10276 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RARAP10276 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RARAP10276 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RARAP10276 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RARAP10276 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RARAP10276 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RARAP10276 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RARAP10276 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RARAP10276 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RARAP10276 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RARAP10276 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
RARAP10276 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RARAP10276 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RARAP10276 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RARAP10276 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RARAP10276 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RARAP10276 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RARAP10276 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RARAP10276 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RARAP10276 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RARAP10276 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RARAP10276 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RARAP10276 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RARAP10276 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RARAP10276 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RARAP10276 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RARAP10276 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RARAP10276 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RARAP10276 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RARAP10276 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RARAP10276 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RARAP10276 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RARAP10276 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RARAP10276 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RARAP10276 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RARAP10276 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RARAP10276 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RARAP10276 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RARAP10276 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RARAP10276 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RARAP10276 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RARAP10276 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RARAP10276 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RARAP10276 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RARAP10276 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RARAP10276 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RARAP10276 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RARAP10276 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RARAP10276 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RARAP10276 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RARAP10276 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RARAP10276 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RARAP10276 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RARAP10276 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RARAP10276 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RARAP10276 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RARAP10276 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RARAP10276 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RARAP10276 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RARAP10276 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RARAP10276 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RARAP10276 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RARAP10276 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RARAP10276 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RARAP10276 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RARAP10276 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RARAP10276 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RARAP10276 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RARAP10276 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RARAP10276 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RARAP10276 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RARAP10276 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RARAP10276 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RARAP10276 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RARAP10276 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms