Protein–RNA interactions for Protein: P0DKB5

TPBGL, Trophoblast glycoprotein-like, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPBGLP0DKB5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPBGLP0DKB5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPBGLP0DKB5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TPBGLP0DKB5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPBGLP0DKB5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TPBGLP0DKB5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TPBGLP0DKB5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPBGLP0DKB5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPBGLP0DKB5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPBGLP0DKB5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPBGLP0DKB5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPBGLP0DKB5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPBGLP0DKB5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPBGLP0DKB5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPBGLP0DKB5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPBGLP0DKB5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPBGLP0DKB5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TPBGLP0DKB5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TPBGLP0DKB5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TPBGLP0DKB5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPBGLP0DKB5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPBGLP0DKB5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPBGLP0DKB5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPBGLP0DKB5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPBGLP0DKB5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPBGLP0DKB5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPBGLP0DKB5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPBGLP0DKB5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPBGLP0DKB5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPBGLP0DKB5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPBGLP0DKB5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPBGLP0DKB5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPBGLP0DKB5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPBGLP0DKB5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPBGLP0DKB5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPBGLP0DKB5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPBGLP0DKB5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPBGLP0DKB5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPBGLP0DKB5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPBGLP0DKB5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TPBGLP0DKB5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPBGLP0DKB5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPBGLP0DKB5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPBGLP0DKB5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPBGLP0DKB5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TPBGLP0DKB5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPBGLP0DKB5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPBGLP0DKB5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPBGLP0DKB5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPBGLP0DKB5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPBGLP0DKB5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPBGLP0DKB5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPBGLP0DKB5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPBGLP0DKB5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPBGLP0DKB5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPBGLP0DKB5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPBGLP0DKB5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPBGLP0DKB5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPBGLP0DKB5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TPBGLP0DKB5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TPBGLP0DKB5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TPBGLP0DKB5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPBGLP0DKB5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPBGLP0DKB5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPBGLP0DKB5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPBGLP0DKB5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPBGLP0DKB5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPBGLP0DKB5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPBGLP0DKB5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TPBGLP0DKB5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPBGLP0DKB5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPBGLP0DKB5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPBGLP0DKB5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPBGLP0DKB5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPBGLP0DKB5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPBGLP0DKB5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPBGLP0DKB5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPBGLP0DKB5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPBGLP0DKB5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPBGLP0DKB5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPBGLP0DKB5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPBGLP0DKB5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPBGLP0DKB5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPBGLP0DKB5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPBGLP0DKB5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPBGLP0DKB5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPBGLP0DKB5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPBGLP0DKB5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPBGLP0DKB5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPBGLP0DKB5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPBGLP0DKB5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPBGLP0DKB5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPBGLP0DKB5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPBGLP0DKB5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPBGLP0DKB5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPBGLP0DKB5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPBGLP0DKB5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPBGLP0DKB5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPBGLP0DKB5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPBGLP0DKB5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms