Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC175P0C221 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC175P0C221 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC175P0C221 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC175P0C221 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC175P0C221 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC175P0C221 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC175P0C221 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC175P0C221 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC175P0C221 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC175P0C221 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC175P0C221 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC175P0C221 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC175P0C221 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC175P0C221 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC175P0C221 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC175P0C221 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC175P0C221 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC175P0C221 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC175P0C221 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC175P0C221 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC175P0C221 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC175P0C221 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC175P0C221 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC175P0C221 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC175P0C221 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC175P0C221 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC175P0C221 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC175P0C221 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC175P0C221 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC175P0C221 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC175P0C221 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC175P0C221 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC175P0C221 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC175P0C221 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC175P0C221 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC175P0C221 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC175P0C221 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC175P0C221 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC175P0C221 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC175P0C221 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC175P0C221 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC175P0C221 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC175P0C221 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC175P0C221 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC175P0C221 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC175P0C221 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC175P0C221 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC175P0C221 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC175P0C221 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC175P0C221 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC175P0C221 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC175P0C221 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC175P0C221 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC175P0C221 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC175P0C221 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC175P0C221 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC175P0C221 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC175P0C221 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC175P0C221 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC175P0C221 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC175P0C221 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC175P0C221 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC175P0C221 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC175P0C221 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC175P0C221 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC175P0C221 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC175P0C221 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC175P0C221 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC175P0C221 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC175P0C221 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC175P0C221 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC175P0C221 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC175P0C221 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC175P0C221 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC175P0C221 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC175P0C221 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC175P0C221 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC175P0C221 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC175P0C221 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC175P0C221 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC175P0C221 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC175P0C221 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC175P0C221 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC175P0C221 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC175P0C221 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC175P0C221 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC175P0C221 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC175P0C221 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC175P0C221 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC175P0C221 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC175P0C221 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC175P0C221 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC175P0C221 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC175P0C221 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC175P0C221 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC175P0C221 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC175P0C221 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC175P0C221 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC175P0C221 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms