Protein–RNA interactions for Protein: P09848

LCT, Lactase-phlorizin hydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 1,927 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCTP09848 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
LCTP09848 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LCTP09848 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LCTP09848 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LCTP09848 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LCTP09848 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
LCTP09848 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LCTP09848 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LCTP09848 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LCTP09848 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LCTP09848 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LCTP09848 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LCTP09848 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LCTP09848 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LCTP09848 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LCTP09848 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LCTP09848 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LCTP09848 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LCTP09848 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LCTP09848 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LCTP09848 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LCTP09848 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LCTP09848 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LCTP09848 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LCTP09848 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LCTP09848 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LCTP09848 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LCTP09848 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
LCTP09848 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LCTP09848 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LCTP09848 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
LCTP09848 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
LCTP09848 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
LCTP09848 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LCTP09848 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LCTP09848 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LCTP09848 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LCTP09848 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LCTP09848 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LCTP09848 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LCTP09848 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LCTP09848 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LCTP09848 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LCTP09848 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LCTP09848 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LCTP09848 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
LCTP09848 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LCTP09848 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LCTP09848 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LCTP09848 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LCTP09848 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LCTP09848 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LCTP09848 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LCTP09848 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LCTP09848 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LCTP09848 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
LCTP09848 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
LCTP09848 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LCTP09848 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LCTP09848 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LCTP09848 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LCTP09848 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
LCTP09848 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LCTP09848 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LCTP09848 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LCTP09848 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LCTP09848 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LCTP09848 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LCTP09848 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LCTP09848 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LCTP09848 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LCTP09848 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LCTP09848 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LCTP09848 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LCTP09848 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LCTP09848 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LCTP09848 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LCTP09848 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LCTP09848 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LCTP09848 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
LCTP09848 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LCTP09848 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LCTP09848 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LCTP09848 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LCTP09848 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
LCTP09848 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LCTP09848 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LCTP09848 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LCTP09848 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LCTP09848 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LCTP09848 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LCTP09848 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LCTP09848 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LCTP09848 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LCTP09848 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LCTP09848 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LCTP09848 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LCTP09848 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LCTP09848 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LCTP09848 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms