Protein–RNA interactions for Protein: P08047

SP1, Transcription factor Sp1, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP1P08047 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SP1P08047 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SP1P08047 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SP1P08047 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SP1P08047 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SP1P08047 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SP1P08047 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SP1P08047 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SP1P08047 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SP1P08047 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SP1P08047 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SP1P08047 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SP1P08047 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SP1P08047 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SP1P08047 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SP1P08047 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SP1P08047 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SP1P08047 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SP1P08047 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SP1P08047 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SP1P08047 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SP1P08047 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SP1P08047 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SP1P08047 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SP1P08047 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SP1P08047 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SP1P08047 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SP1P08047 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SP1P08047 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SP1P08047 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SP1P08047 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SP1P08047 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SP1P08047 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SP1P08047 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SP1P08047 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SP1P08047 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SP1P08047 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SP1P08047 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SP1P08047 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SP1P08047 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SP1P08047 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SP1P08047 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SP1P08047 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SP1P08047 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SP1P08047 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SP1P08047 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SP1P08047 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SP1P08047 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SP1P08047 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SP1P08047 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP1P08047 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP1P08047 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP1P08047 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP1P08047 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP1P08047 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SP1P08047 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SP1P08047 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SP1P08047 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SP1P08047 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SP1P08047 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SP1P08047 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SP1P08047 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP1P08047 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP1P08047 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP1P08047 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP1P08047 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP1P08047 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP1P08047 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SP1P08047 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP1P08047 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP1P08047 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SP1P08047 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SP1P08047 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SP1P08047 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SP1P08047 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SP1P08047 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SP1P08047 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SP1P08047 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SP1P08047 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SP1P08047 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SP1P08047 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SP1P08047 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SP1P08047 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SP1P08047 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SP1P08047 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SP1P08047 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SP1P08047 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SP1P08047 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SP1P08047 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SP1P08047 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SP1P08047 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP1P08047 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP1P08047 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP1P08047 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SP1P08047 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP1P08047 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SP1P08047 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SP1P08047 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SP1P08047 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SP1P08047 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.4 ms