Protein–RNA interactions for Protein: P07858

CTSB, Cathepsin B, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSBP07858 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTSBP07858 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTSBP07858 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CTSBP07858 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTSBP07858 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTSBP07858 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTSBP07858 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CTSBP07858 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CTSBP07858 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTSBP07858 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTSBP07858 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTSBP07858 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTSBP07858 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTSBP07858 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTSBP07858 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTSBP07858 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTSBP07858 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTSBP07858 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTSBP07858 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTSBP07858 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTSBP07858 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTSBP07858 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTSBP07858 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTSBP07858 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTSBP07858 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTSBP07858 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTSBP07858 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTSBP07858 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSBP07858 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSBP07858 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSBP07858 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSBP07858 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSBP07858 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSBP07858 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTSBP07858 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSBP07858 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSBP07858 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSBP07858 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSBP07858 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSBP07858 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSBP07858 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSBP07858 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSBP07858 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSBP07858 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSBP07858 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTSBP07858 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSBP07858 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSBP07858 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSBP07858 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSBP07858 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSBP07858 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSBP07858 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSBP07858 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSBP07858 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSBP07858 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CTSBP07858 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSBP07858 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSBP07858 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSBP07858 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSBP07858 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSBP07858 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CTSBP07858 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSBP07858 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSBP07858 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSBP07858 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSBP07858 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSBP07858 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSBP07858 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSBP07858 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSBP07858 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSBP07858 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTSBP07858 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTSBP07858 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTSBP07858 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSBP07858 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSBP07858 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSBP07858 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSBP07858 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSBP07858 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSBP07858 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSBP07858 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSBP07858 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSBP07858 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSBP07858 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSBP07858 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSBP07858 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSBP07858 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSBP07858 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSBP07858 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSBP07858 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSBP07858 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSBP07858 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSBP07858 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSBP07858 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSBP07858 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSBP07858 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSBP07858 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSBP07858 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSBP07858 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSBP07858 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms