Protein–RNA interactions for Protein: P05549

TFAP2A, Transcription factor AP-2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2AP05549 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFAP2AP05549 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFAP2AP05549 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFAP2AP05549 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFAP2AP05549 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFAP2AP05549 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFAP2AP05549 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFAP2AP05549 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFAP2AP05549 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFAP2AP05549 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFAP2AP05549 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFAP2AP05549 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFAP2AP05549 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFAP2AP05549 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFAP2AP05549 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFAP2AP05549 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFAP2AP05549 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFAP2AP05549 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFAP2AP05549 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFAP2AP05549 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFAP2AP05549 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFAP2AP05549 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFAP2AP05549 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFAP2AP05549 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TFAP2AP05549 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TFAP2AP05549 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TFAP2AP05549 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TFAP2AP05549 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFAP2AP05549 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFAP2AP05549 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFAP2AP05549 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFAP2AP05549 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFAP2AP05549 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFAP2AP05549 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TFAP2AP05549 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFAP2AP05549 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFAP2AP05549 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFAP2AP05549 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFAP2AP05549 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFAP2AP05549 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFAP2AP05549 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFAP2AP05549 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFAP2AP05549 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFAP2AP05549 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFAP2AP05549 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFAP2AP05549 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFAP2AP05549 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFAP2AP05549 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFAP2AP05549 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TFAP2AP05549 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TFAP2AP05549 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TFAP2AP05549 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TFAP2AP05549 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TFAP2AP05549 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TFAP2AP05549 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TFAP2AP05549 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TFAP2AP05549 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TFAP2AP05549 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TFAP2AP05549 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TFAP2AP05549 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TFAP2AP05549 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TFAP2AP05549 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TFAP2AP05549 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TFAP2AP05549 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TFAP2AP05549 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TFAP2AP05549 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TFAP2AP05549 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TFAP2AP05549 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFAP2AP05549 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFAP2AP05549 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFAP2AP05549 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFAP2AP05549 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFAP2AP05549 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFAP2AP05549 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFAP2AP05549 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFAP2AP05549 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFAP2AP05549 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFAP2AP05549 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFAP2AP05549 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFAP2AP05549 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFAP2AP05549 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFAP2AP05549 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFAP2AP05549 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFAP2AP05549 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFAP2AP05549 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFAP2AP05549 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFAP2AP05549 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TFAP2AP05549 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFAP2AP05549 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFAP2AP05549 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFAP2AP05549 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFAP2AP05549 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFAP2AP05549 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFAP2AP05549 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFAP2AP05549 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFAP2AP05549 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFAP2AP05549 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFAP2AP05549 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFAP2AP05549 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFAP2AP05549 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms