Protein–RNA interactions for Protein: P04436

T-cell receptor alpha chain V region HPB-MLT (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04436 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
P04436 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
P04436 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
P04436 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P04436 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
P04436 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P04436 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
P04436 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P04436 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
P04436 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
P04436 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
P04436 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P04436 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
P04436 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P04436 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P04436 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
P04436 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
P04436 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
P04436 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
P04436 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
P04436 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P04436 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P04436 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
P04436 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P04436 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P04436 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
P04436 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
P04436 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
P04436 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
P04436 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P04436 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P04436 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P04436 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P04436 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P04436 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P04436 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
P04436 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
P04436 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
P04436 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
P04436 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P04436 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
P04436 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
P04436 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P04436 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P04436 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
P04436 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
P04436 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P04436 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
P04436 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P04436 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
P04436 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
P04436 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
P04436 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P04436 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P04436 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P04436 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
P04436 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P04436 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P04436 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P04436 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P04436 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P04436 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P04436 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
P04436 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
P04436 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
P04436 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P04436 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
P04436 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
P04436 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
P04436 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P04436 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P04436 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P04436 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
P04436 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P04436 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
P04436 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P04436 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P04436 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
P04436 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
P04436 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P04436 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P04436 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
P04436 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P04436 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P04436 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P04436 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P04436 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
P04436 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P04436 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
P04436 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
P04436 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P04436 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
P04436 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
P04436 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P04436 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P04436 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
P04436 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P04436 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P04436 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
P04436 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms