Protein–RNA interactions for Protein: P04279

SEMG1, Semenogelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMG1P04279 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMG1P04279 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMG1P04279 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMG1P04279 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMG1P04279 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMG1P04279 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMG1P04279 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMG1P04279 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMG1P04279 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMG1P04279 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMG1P04279 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMG1P04279 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMG1P04279 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMG1P04279 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMG1P04279 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMG1P04279 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMG1P04279 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMG1P04279 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMG1P04279 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMG1P04279 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMG1P04279 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMG1P04279 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMG1P04279 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMG1P04279 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMG1P04279 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMG1P04279 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMG1P04279 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMG1P04279 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMG1P04279 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMG1P04279 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMG1P04279 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMG1P04279 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMG1P04279 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMG1P04279 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMG1P04279 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMG1P04279 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMG1P04279 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMG1P04279 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMG1P04279 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMG1P04279 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMG1P04279 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SEMG1P04279 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SEMG1P04279 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMG1P04279 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMG1P04279 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMG1P04279 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMG1P04279 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMG1P04279 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMG1P04279 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMG1P04279 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMG1P04279 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMG1P04279 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMG1P04279 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMG1P04279 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMG1P04279 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMG1P04279 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMG1P04279 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEMG1P04279 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMG1P04279 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMG1P04279 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMG1P04279 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMG1P04279 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMG1P04279 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMG1P04279 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMG1P04279 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEMG1P04279 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMG1P04279 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMG1P04279 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMG1P04279 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMG1P04279 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMG1P04279 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMG1P04279 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMG1P04279 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMG1P04279 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMG1P04279 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEMG1P04279 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEMG1P04279 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEMG1P04279 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEMG1P04279 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMG1P04279 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMG1P04279 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMG1P04279 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMG1P04279 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMG1P04279 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMG1P04279 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMG1P04279 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMG1P04279 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMG1P04279 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMG1P04279 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMG1P04279 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMG1P04279 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMG1P04279 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMG1P04279 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMG1P04279 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMG1P04279 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMG1P04279 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMG1P04279 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMG1P04279 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMG1P04279 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMG1P04279 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms