Protein–RNA interactions for Protein: P04180

LCAT, Phosphatidylcholine-sterol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCATP04180 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LCATP04180 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LCATP04180 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LCATP04180 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LCATP04180 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LCATP04180 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LCATP04180 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LCATP04180 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LCATP04180 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LCATP04180 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LCATP04180 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LCATP04180 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LCATP04180 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LCATP04180 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LCATP04180 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LCATP04180 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LCATP04180 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LCATP04180 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LCATP04180 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LCATP04180 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LCATP04180 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LCATP04180 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LCATP04180 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LCATP04180 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LCATP04180 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LCATP04180 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LCATP04180 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LCATP04180 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LCATP04180 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LCATP04180 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LCATP04180 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LCATP04180 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LCATP04180 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LCATP04180 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LCATP04180 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LCATP04180 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LCATP04180 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LCATP04180 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LCATP04180 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LCATP04180 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LCATP04180 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LCATP04180 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LCATP04180 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LCATP04180 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LCATP04180 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LCATP04180 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LCATP04180 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LCATP04180 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LCATP04180 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LCATP04180 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LCATP04180 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LCATP04180 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LCATP04180 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LCATP04180 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LCATP04180 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LCATP04180 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LCATP04180 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LCATP04180 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LCATP04180 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LCATP04180 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LCATP04180 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LCATP04180 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LCATP04180 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LCATP04180 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LCATP04180 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LCATP04180 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LCATP04180 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LCATP04180 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LCATP04180 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LCATP04180 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LCATP04180 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LCATP04180 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LCATP04180 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LCATP04180 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LCATP04180 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LCATP04180 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LCATP04180 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LCATP04180 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LCATP04180 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LCATP04180 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LCATP04180 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LCATP04180 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LCATP04180 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LCATP04180 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LCATP04180 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LCATP04180 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LCATP04180 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LCATP04180 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LCATP04180 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LCATP04180 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LCATP04180 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LCATP04180 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LCATP04180 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LCATP04180 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LCATP04180 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LCATP04180 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LCATP04180 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LCATP04180 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LCATP04180 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LCATP04180 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms