Protein–RNA interactions for Protein: P01893

HLA-H, Putative HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain H, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-HP01893 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-HP01893 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-HP01893 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-HP01893 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-HP01893 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-HP01893 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-HP01893 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-HP01893 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-HP01893 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-HP01893 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-HP01893 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-HP01893 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-HP01893 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-HP01893 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-HP01893 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-HP01893 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-HP01893 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-HP01893 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-HP01893 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-HP01893 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-HP01893 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-HP01893 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-HP01893 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-HP01893 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-HP01893 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-HP01893 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-HP01893 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-HP01893 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-HP01893 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-HP01893 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-HP01893 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-HP01893 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-HP01893 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-HP01893 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-HP01893 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-HP01893 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-HP01893 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-HP01893 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HLA-HP01893 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-HP01893 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-HP01893 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-HP01893 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HLA-HP01893 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-HP01893 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-HP01893 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HLA-HP01893 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-HP01893 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-HP01893 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-HP01893 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-HP01893 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-HP01893 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HLA-HP01893 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-HP01893 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-HP01893 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-HP01893 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-HP01893 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HLA-HP01893 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HLA-HP01893 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HLA-HP01893 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HLA-HP01893 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HLA-HP01893 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HLA-HP01893 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HLA-HP01893 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HLA-HP01893 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HLA-HP01893 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HLA-HP01893 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HLA-HP01893 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HLA-HP01893 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HLA-HP01893 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HLA-HP01893 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HLA-HP01893 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HLA-HP01893 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HLA-HP01893 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLA-HP01893 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLA-HP01893 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLA-HP01893 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLA-HP01893 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLA-HP01893 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLA-HP01893 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLA-HP01893 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HLA-HP01893 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLA-HP01893 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLA-HP01893 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLA-HP01893 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLA-HP01893 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLA-HP01893 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HLA-HP01893 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HLA-HP01893 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HLA-HP01893 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HLA-HP01893 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HLA-HP01893 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HLA-HP01893 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HLA-HP01893 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HLA-HP01893 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HLA-HP01893 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-HP01893 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-HP01893 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-HP01893 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-HP01893 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HLA-HP01893 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms