Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
EGFRP00533 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
EGFRP00533 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
EGFRP00533 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
EGFRP00533 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
EGFRP00533 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
EGFRP00533 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
EGFRP00533 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
EGFRP00533 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
EGFRP00533 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
EGFRP00533 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
EGFRP00533 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
EGFRP00533 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
EGFRP00533 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
EGFRP00533 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
EGFRP00533 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
EGFRP00533 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
EGFRP00533 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
EGFRP00533 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
EGFRP00533 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
EGFRP00533 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
EGFRP00533 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
EGFRP00533 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
EGFRP00533 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
EGFRP00533 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
EGFRP00533 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
EGFRP00533 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
EGFRP00533 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
EGFRP00533 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
EGFRP00533 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
EGFRP00533 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
EGFRP00533 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
EGFRP00533 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
EGFRP00533 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
EGFRP00533 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
EGFRP00533 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
EGFRP00533 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
EGFRP00533 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
EGFRP00533 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EGFRP00533 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EGFRP00533 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
EGFRP00533 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
EGFRP00533 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EGFRP00533 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
EGFRP00533 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
EGFRP00533 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EGFRP00533 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
EGFRP00533 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EGFRP00533 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EGFRP00533 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EGFRP00533 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EGFRP00533 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EGFRP00533 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
EGFRP00533 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
EGFRP00533 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
EGFRP00533 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
EGFRP00533 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
EGFRP00533 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
EGFRP00533 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
EGFRP00533 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EGFRP00533 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
EGFRP00533 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
EGFRP00533 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EGFRP00533 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
EGFRP00533 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EGFRP00533 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
EGFRP00533 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EGFRP00533 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
EGFRP00533 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
EGFRP00533 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
EGFRP00533 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EGFRP00533 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EGFRP00533 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EGFRP00533 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EGFRP00533 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EGFRP00533 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EGFRP00533 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
EGFRP00533 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
EGFRP00533 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
EGFRP00533 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EGFRP00533 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
EGFRP00533 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
EGFRP00533 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
EGFRP00533 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
EGFRP00533 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
EGFRP00533 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
EGFRP00533 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
EGFRP00533 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
EGFRP00533 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
EGFRP00533 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
EGFRP00533 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
EGFRP00533 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
EGFRP00533 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
EGFRP00533 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
EGFRP00533 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
EGFRP00533 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
EGFRP00533 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
EGFRP00533 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
EGFRP00533 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
EGFRP00533 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms