Protein–RNA interactions for Protein: P00480

OTC, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTCP00480 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
OTCP00480 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
OTCP00480 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTCP00480 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTCP00480 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTCP00480 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTCP00480 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTCP00480 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
OTCP00480 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTCP00480 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTCP00480 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTCP00480 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
OTCP00480 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
OTCP00480 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTCP00480 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTCP00480 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTCP00480 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTCP00480 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTCP00480 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTCP00480 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTCP00480 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTCP00480 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTCP00480 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTCP00480 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTCP00480 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTCP00480 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTCP00480 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTCP00480 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
OTCP00480 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTCP00480 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTCP00480 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTCP00480 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
OTCP00480 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTCP00480 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTCP00480 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTCP00480 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTCP00480 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTCP00480 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTCP00480 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTCP00480 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTCP00480 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTCP00480 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTCP00480 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTCP00480 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
OTCP00480 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
OTCP00480 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
OTCP00480 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
OTCP00480 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
OTCP00480 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
OTCP00480 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTCP00480 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTCP00480 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTCP00480 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTCP00480 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTCP00480 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTCP00480 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTCP00480 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTCP00480 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTCP00480 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTCP00480 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTCP00480 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTCP00480 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTCP00480 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTCP00480 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTCP00480 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTCP00480 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTCP00480 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTCP00480 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTCP00480 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTCP00480 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTCP00480 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTCP00480 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTCP00480 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTCP00480 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTCP00480 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTCP00480 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTCP00480 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTCP00480 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTCP00480 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTCP00480 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTCP00480 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTCP00480 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTCP00480 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTCP00480 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTCP00480 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTCP00480 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTCP00480 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
OTCP00480 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTCP00480 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTCP00480 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTCP00480 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTCP00480 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTCP00480 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTCP00480 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
OTCP00480 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
OTCP00480 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTCP00480 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTCP00480 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
OTCP00480 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTCP00480 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms